MOLECULAR DETECTION OF CLARITHROMYCIN AND FLUOROQUINOLONES RESISTANCE IN HELICOBACTER PYLORI INFECTION, DIRECTLY APPLIED TO GASTRIC BIOPSIES, IN AN URBAN BRAZILIAN POPULATION
| Autor: | Bruno Squarcio Fernandes Sanches, Luciana Dias Moretzsohn, Karine Sampaio Lima, Bianca Della Croce Vieira Cota, Luiz Gonzaga Vaz Coelho, Gustavo Miranda Martins |
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| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: |
Male
0301 basic medicine Urban Population Biopsy Antibiotics Prevalence Anti-infecciosos Drug resistance Gastroenterology 0302 clinical medicine Risk Factors Clarithromycin Genotype Claritromicina education.field_of_study biology Middle Aged Anti-Bacterial Agents Female 030211 gastroenterology & hepatology Fluoroquinolonas Anti-infective agents Fluoroquinolones medicine.drug Adult medicine.medical_specialty medicine.drug_class 030106 microbiology Population Helicobacter Infections Microbiology Young Adult 03 medical and health sciences Antibiotic resistance Internal medicine Drug Resistance Bacterial medicine Humans Patologia molecular lcsh:RC799-869 education Aged Molecular pathology Helicobacter pylori business.industry biology.organism_classification Mutation lcsh:Diseases of the digestive system. Gastroenterology business |
| Zdroj: | Arquivos de Gastroenterologia, Vol 53, Iss 2, Pp 113-117 Arquivos de Gastroenterologia, Volume: 53, Issue: 2, Pages: 113-117, Published: JUN 2016 Arquivos de Gastroenterologia v.53 n.2 2016 Arquivos de gastroenterologia Instituto Brasileiro de Estudos e Pesquisas de Gastroenterologia instacron:IBEPEGE |
| ISSN: | 0004-2803 |
| Popis: | Background - Antimicrobial resistance is the major factor leading to eradication failure in H. pylori treatment. Molecular tests are useful to detect genetic mutations predictive of clarithromycin and fluoroquinolones resistance. Knowledge of the local prevalence rate of resistance is important to define the best recommended treatment. Objective - To assess the prevalence of primary resistance of H. pylori to clarithromycin and fluoroquinolones, using a molecular test, in a Southeastern urban Brazilian population. Methods - A total of 72 H. pylori seropositive patients [65% female, mean age 39 (19-73) years] never treated before for this infection were studied. All patients underwent gastroscopy in addition to antrum and corpus biopsies and molecular test GenoType HelicoDR (Hain Life Science, Germany) to detect H. pylori and point mutations in genes responsible for clarithromycin and fluoroquinolone resistance. The molecular procedure was divided into three steps: DNA extraction from biopsy samples, a multiplex amplification with biotinylated primers and a reverse hybridization. The most frequent point mutations involved in resistance to the two antibiotics were evaluated. Results - Resistance to clarithromycin was detected in nine (12.5%) patients and to fluoroquinolones in eight (11.1%) patients. The point mutation A2147G was the most common (77.8%) among resistant strains to clarithromycin. In 50% of the resistant strains to fluoroquinolones, the mutant codon couldn't be identified. Conclusion - The resistance rates to clarithromycin and fluorquinolones in a large urban population in the Southeast of Brazil were acceptable, suggesting that these drugs remain appropriate options to first and second-line of H. pylori treatment. The molecular test represents an adequate diagnostic tool for monitoring H. pylori resistance. RESUMO Contexto - A resistência aos antimicrobianos é o principal fator associado à falha terapêutica no tratamento do H. pylori. Testes moleculares são úteis na detecção das mutações genéticas associadas ao desenvolvimento de resistência à claritromicina e fluorquinolonas. O conhecimento da taxa de prevalência local de resistência é importante na definição do melhor esquema terapêutico. Objetivo - Estimar a prevalência de resistência primária do H. pylori à claritromicina e fluorquinolonas, empregando-se um teste molecular, em uma capital do Sudeste do Brasil. Métodos - Setenta e dois pacientes com sorologia positiva para H. pylori [65% mulheres, idade média 39 (19-73) anos], nunca tratados previamente para essa infecção, foram selecionados. Todos os pacientes submeteram-se à endoscopia digestiva com biópsias de antro e corpo e realização do teste molecular GenoType HelicoDR (Hain Life Science, Alemanha) para a detecção do H. pylori e das mutações pontuais dos genes responsáveis pela resistência à claritromicina e fluorquinolonas. O procedimento molecular constituía-se de três etapas: extração do DNA a partir das amostras endoscópicas, amplificação multiplex com primers biotinilados e hibridização reversa. As mutações pontuais mais frequentemente envolvidas com resistência aos dois antibióticos foram avaliadas. Resultados - Resistência à claritromicina foi detectada em nove (12,5%) pacientes e às fluorquinolonas em oito (11,1%) pacientes. A mutação pontual A2147G foi a mais comum (77,8%) entre as cepas resistentes à claritromicina. Em 50% das cepas resistentes à fluorquinolonas, o códon mutante não pôde ser identificado. Conclusão - As taxas de resistência à claritromicina (12,5%) e às fluorquinolonas (11,1%), em uma importante capital do Sudeste do Brasil, mostraram índices aceitáveis, sugerindo que essas drogas permanecem opções apropriadas para o tratamento de primeira e segunda linha do H. pylori. O teste molecular constitui uma ferramenta diagnóstica adequada para monitorar a resistência do H. pylori. |
| Databáze: | OpenAIRE |
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