Molecular characterization of a species in the genus Rubus in Boyacá, Colombia
| Autor: | Fánor Casierra Posada, Brigitte Liliana Moreno–Medina |
|---|---|
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2021 |
| Předmět: |
0106 biological sciences
alelos Plant Science Biology heterocigocidade 01 natural sciences SB1-1110 03 medical and health sciences Genus Genotype Botany Genetic variation heterozygosity Allele 030304 developmental biology 0303 health sciences Genetic diversity Cultivated plant taxonomy variabilidade variability Plant culture food and beverages genetic diversity biology.organism_classification SSR alleles Microsatellite Rubus diversidade genética Agronomy and Crop Science 010606 plant biology & botany Food Science |
| Zdroj: | Revista Brasileira de Fruticultura v.43 n.2 2021 Revista brasileira de fruticultura Sociedade Brasileira de Fruticultura (SBF) instacron:SBFRU Revista Brasileira de Fruticultura, Vol 43, Iss 2 (2021) Revista Brasileira de Fruticultura, Volume: 43, Issue: 2, Article number: e-713, Published: 28 MAY 2021 |
| Popis: | Colombia is home to blackberry genetic resources which present a morphological diversity. The relevant characteristics related to its diversity are the presence of prickles, the shape of its leaves, the number and color of its fruits, and its enormous agro-industrial potential due bioactive compounds such as polyphenols. These plants can grow between 1,700 and 3,400 m asl and are cultivated in the central region of the country. The study evaluated 13 wild and cultivated plants from the genus Rubus. A molecular characterization was carried out using 16 SSR microsatellite markers, all of which produced positive amplification generating 23 loci and 26 alleles. The AMOVA indicated a molecular genetic differentiation of 23% between the groups which corresponded to the geographic location of the sample. The greatest contribution to variance is found within the groups (76%), possibly because each of them is composed of different cultivated species and wild relatives of the genus Rubus. This suggests that the grouping of the genotypes studied doesn’t necessarily correspond to geographical origin. However, the findings show high genetic variation, with an Fst value of 0.27. This may be useful in breeding programs where genetic diversity, morphological characteristics of the fruits, and the molecular identification of the fruits are taken into account. Resumo A Colômbia conta com recursos genéticos de amora que apresentam ampla diversidade morfológica. Entre os caracteres mais relevantes relacionados com sua diversidade, encontram-se a presença de aguilhões, a forma das folhas, o número e a cor dos frutos, e seu enorme potencial agroindustrial devido a seu dulçor e a seus compostos bioativos, como os polifenóis. Estas plantas podem crescer entre 1.700 e 3.400 metros acima do nível do mar. No presente estudo, avaliaram-se 13 materiais silvestres e cultivados do gênero Rubus. Realizou-se sua caracterização molecular mediante 16 marcadores microssatélites SSR, dos quais, todos produziram amplificação positiva, gerando 23 lócus e 26 alelos. A AMOVA indicou uma diferenciação genética molecular de 23% entre os grupos, os quais correspondem à localização geográfica da amostra, e o maior aporte à variância está no interior dos grupos (76%), possivelmente devido a que cada um deles está composto por diferentes espécies cultivadas e parentes silvestres do gênero . RubusIsto sugere que a agrupação dos genótipos estudados não necessariamente corresponde à origem geográfica. Não obstante, as descobertas evidenciam alta variação genética, com o valor Fst de 0.27, a qual pode ser útil em futuros programas de fitomelhoramento, nos quais se tenham em conta a diversidade genética, as características morfológicas dos frutos e a identificação molecular das cultivares. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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