Detection and molecular characterization of ilarvirus and ampelovirus coat protein genes infecting temperate fruit trees
| Autor: | Thor Vinícius Martins Fajardo, Osmar Nickel, Marcelo Eiras |
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| Přispěvatelé: | THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV, OSMAR NICKEL, CNPUV, MARCELO EIRAS, INSTITUTO BIOLÓGICO. |
| Jazyk: | portugalština |
| Rok vydání: | 2011 |
| Předmět: |
apple
Prune dwarf virus Biology Molecular cloning pessegueiro Virus peach GLRaV-1 Doença de planta Plant virus Complementary DNA Gene PDV Apple mosaic virus macieira General Veterinary Host (biology) Vírus biology.organism_classification Virology grapevine Maçã ApMV Fruticultura Uva videira Proteína capsidial de ilarvírus Pêssego Animal Science and Zoology Proteína capsidial de ampelovírus Agronomy and Crop Science |
| Zdroj: | Ciência Rural v.41 n.1 2011 Ciência Rural Universidade Federal de Santa Maria (UFSM) instacron:UFSM Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA-Alice) Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) instacron:EMBRAPA Ciência Rural, Volume: 41, Issue: 1, Pages: 5-9, Published: 2011 |
| Popis: | Dentre os principais patógenos que incidem em fruteiras temperadas, destacam-se o Prune dwarf virus (PDV), o Apple mosaic virus (ApMV) e o Grapevine leafroll-associated virus 1 (GLRaV-1). Neste trabalho foram realizadas a detecção e a caracterização molecular dos genes da proteína capsidial de isolados destas três espécies virais. RNAs totais foram extraídos de amostras de folhas de pessegueiros, macieiras e videiras e, nas reações de RT-PCR, foram utilizados oligonucleotídeos específicos para cada espécie viral. Os cDNAs amplificados foram clonados e sequenciados. Foram verificadas altas identidades entre as sequências de nucleotídeos dos genes da proteína capsidial dos isolados brasileiros de PDV, ApMV e GLRaV-1 e isolados de outros países, independente da origem geográfica e da hospedeira. O peso molecular da proteína capsidial destes vírus foi estimado por meio de Western blot em cerca de 24kDa (PDV), 26kDa (ApMV) e 39kDa (GLRaV-1). Among the main pathogens infecting temperate fruit trees are Prune dwarf virus, Apple mosaic virus and Grapevine leafroll-associated virus 1. In this work the detection and molecular characterization of the coat protein genes of isolates from these viral species were carried out. Total RNA was extracted from peach, apple and grapevine leaves and RT-PCR reactions were performed using specific primers to each virus. The amplified cDNA fragments were cloned and sequenced. High identities were observed between coat protein nucleotide sequences of Brazilian isolates of PDV, ApMV and GLRaV-1 and isolates from other countries, independently from geographic origin and host. Coat protein molecular weights of these viruses were estimated by Western blot to be ca. 24kDa (PDV), 26kDa (ApMV) and 39kDa (GLRaV-1). |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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