Wide cross-species RNA-Seq comparison reveals a highly conserved role for Ferroportins in nickel hyperaccumulation in plants
| Autor: | Bruno Fogliani, Guillem Rigaill, Dubiel Alfonso Gonzalez, Louise Barreau, Yohan Pillon, Vanesa S. García de la Torre, Sébastien Thomine, Valerie Burtet-Sarramegna, Clarisse Majorel-Loulergue, Sylvain Merlot, Ludivine Soubigou-Taconnat |
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| Přispěvatelé: | Unité de recherche en génomique végétale (URGV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mathématiques et Informatique Appliquées (MIA-Paris), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Connaissance des ressources végétales tropicales et de leurs usages (BIODIVAL), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Approches intégratives du Transport Ionique (MINION), Département Biologie Cellulaire (BioCell), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Agronomique Néo-Calédonien (IAC), Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut de sciences exactes et appliquées (ISEA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut des sciences du végétal (ISV), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), I2BC - Institut de Biologie Intégrative de la Cellule, Univ New Caledonia, Lab Insulaire Vivant & Environm, Noumea 98851, New Caledonia, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2018 |
| Předmět: |
0106 biological sciences
0303 health sciences Mechanism (biology) [SDV]Life Sciences [q-bio] Ferroportin chemistry.chemical_element RNA-Seq 15. Life on land Metal contaminated soils Biology 01 natural sciences Transcriptome 03 medical and health sciences Nickel chemistry Evolutionary biology biology.protein Plant species [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology Hyperaccumulator 030304 developmental biology 010606 plant biology & botany |
| DOI: | 10.1101/420729 |
| Popis: | The Anthropocene epoch is associated with the spreading of metals in the environment increasing oxidative and genotoxic stress on living organisms1,2. Once regarded as a curiosity, plants hyperaccumulating metals are now envisioned as an opportunity to remediate metal contaminated soils. About 500 plant species adapted to metalliferous soils acquired the capacity to hyperaccumulate (>0.1% of dry weight) nickel in their shoot3. The phylogenetic distribution of these hyperaccumulators in 50 families suggest that this complex trait evolved multiple times independently from basic mechanisms involved in metal homeostasis. However, the exact nature of these mechanisms and whether they are shared between various lineages is not known. Here, using cross-species transcriptomic analyses in different plant families, we have identified convergent functions that may represent major nodes in the evolution of nickel hyperaccumulation. In particular, our data point out that constitutive high expression of IREG/Ferroportin transporters recurrently emerged as a mechanism involved in nickel hyperaccumulation. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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