Utilization of interferometric light microscopy for the rapid analysis of virus abundance in a river

Autor: Catherine Vénien-Bryan, Céline Roose-Amsaleg, Josette Garnier, Albert-Claude Boccara, Martine Boccara, Y. Fedala
Přispěvatelé: HAL UPMC, Gestionnaire, Milieux Environnementaux, Transferts et Interactions dans les hydrosystèmes et les Sols (METIS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Langevin - Ondes et Images (UMR7587) (IL), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB ), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Sorbonne Université (SU)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Paris (UP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)
Rok vydání: 2017
Předmět:
0301 basic medicine
Membrane vesicle
Fresh Water
010501 environmental sciences
Biology
Cyanobacteria
01 natural sciences
Microbiology
Virus
03 medical and health sciences
[SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology
environment/Ecosystems
Microscopy
Electron
Transmission
Rivers
Microscopy
Botany
[SDV.EE.ECO] Life Sciences [q-bio]/Ecology
environment/Ecosystems
Dominance (ecology)
Microscopy
Interference
Biomass
Molecular Biology
0105 earth and related environmental sciences
River
[SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology
[SDE.IE]Environmental Sciences/Environmental Engineering
Ecology
General Medicine
Plankton
Interferometry
030104 developmental biology
Microscopy
Fluorescence
Viruses
[SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology
Seasons
[SDE.IE] Environmental Sciences/Environmental Engineering
Interferometric light microscopy
Zdroj: Research in Microbiology
Research in Microbiology, 2017, ⟨10.1016/j.resmic.2017.02.004⟩
Research in Microbiology, Elsevier, 2017, ⟨10.1016/j.resmic.2017.02.004⟩
ISSN: 0923-2508
Popis: International audience; There is a constant need for direct counting of biotic nanoparticles such as viruses to unravel river functioning. We used, for the first time in freshwater, a new method based on interferometry differentiating viruses from other particles such as membrane vesicles. In the French Marne River, viruses represented between 42 and 72% of the particles. A spring monitoring in 2014 revealed their increase (2.1 × 107 to 2.1 × 108 mL−1) linked to an increase in algal biomass and diversity of bacterial plankton. Predicted virus size distributions were in agreement with transmission electron microscopy analysis suggesting a dominance of large viruses (≥60 nm).
Databáze: OpenAIRE
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