ATOL: The Multi-species Livestock Trait Ontology

Autor: Olivier Dameron, Matthieu Reichstadt, Wiktoria Golik, Jean Vernet, Léa Joret, Claire Nédellec, Pierre-Yves Le Bail, Catherine Hurtaud, Jérôme Bugeon, Alice Fatet, Isabelle Hue, Frédéric Papazian, Marie-Christine Salaun
Přispěvatelé: Unité Mathématique Informatique et Génome (MIG), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGENAE - Analyse du Génome des Animaux d'Elevage (AGENAE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie du développement et reproduction (BDR), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), ProdInra, Archive Ouverte, Unité Mathématique, Informatique et Génome (MIG), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie du Développement et Reproduction (BDR), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mathématique, Informatique et Génome ( MIG ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), AGENAE ( AGENAE ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ( LPGP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] ( PRC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Biologie du Développement et Reproduction ( BDR ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2012
Předmět:
Zdroj: Communications in Computer and Information Science
Metadata and Semantics Research
6. Research Conference, MTSR
6. Research Conference, MTSR, Nov 2012, Cadiz, Spain. pp.289-300, ⟨10.1007/978-3-642-35233-1_28⟩
Communications in Computer and Information Science ISBN: 9783642352324
MTSR
6. Research Conference, MTSR, Nov 2012, Cadiz, Spain. Springer, 2012, pp.289-300, 2012, Communications in Computer and Information Science. 〈10.1007/978-3-642-35233-1_28〉
Metadata and Semantics Research. (2012)2012; 6. Research Conference, MTSR, Cadiz, ESP, 2012-11-28-2012-11-30, 289-300
ISSN: 1865-0929
Popis: It resulted in a detailed taxonomy of 1,654 traits that is available at http://www.atol-ontology.comIt resulted in a detailed taxonomy of 1,654 traits that is available at http://www.atol-ontology.com; This paper presents the multi-species Animal Trait Ontology for Livestock (ATOL) and the methodology used for its design. ATOL has been designed as a reference source for indexing phenotype databases and scientific papers. It covers five major topics related to animal productions: growth and meat quality, animal nutrition, milk production, reproduction and welfare. It is composed of species-independent concepts subsuming species-specific ones so that cross-species and species-specific reasoning can be performed consistently. In order to ensure a large consensus, three complementary approaches have successively been applied to its design: reuse of existing ontologies, integration of production-specific livestock traits by a large team of domain experts and curators and terminology analysis of scientific papers.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: