Transcriptomic study of apricot fruit (Prunus armeniaca) ripening among 13 006 expressed sequence tags
| Autor: | Isabelle Marty, Jérôme Grimplet, Jean-Marc Audergon, Guy Albagnac, Patrick Lambert, Jean-Paul Bouchet, Nancy Terrier, Charles Romieu |
|---|---|
| Přispěvatelé: | Sciences Pour l'Oenologie (SPO), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2005 |
| Předmět: |
0106 biological sciences
Physiology UniGene Plant Science 01 natural sciences Transcriptome 03 medical and health sciences ADNC Complementary DNA Botany Genetics [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology EST ComputingMilieux_MISCELLANEOUS 030304 developmental biology 2. Zero hunger Molecular breeding 0303 health sciences Expressed sequence tag biology cDNA library food and beverages NORTHERN BLOT Ripening Cell Biology General Medicine BIOLOGIE MOLECULAIRE biology.organism_classification Prunus armeniaca 010606 plant biology & botany |
| Zdroj: | Physiologia Plantarum Physiologia Plantarum, Wiley, 2005, 125, pp.281-292. ⟨10.1111/j.1399-3054.2005.00563.x⟩ |
| ISSN: | 0031-9317 1399-3054 |
| DOI: | 10.1111/j.1399-3054.2005.00563.x⟩ |
| Popis: | To improve the knowledge of fruit ripening and to provide genomic resources for molecular breeding of apricot (Prunus armeniaca L), 13 006 expressed sequence tags (ESTs) were generated from three λzap cDNA libraries of the pericarp tissues at different stages of development (Physiol Plant 105: 294-303), yielding 5219 (40%) Unigenes. At this stage, the very low interlibrary redundancy indicated that EST sampling of the transcriptome of apricot pericarp is still far from being saturated. Seventy-six percent of Unigenes displayed homologies with public sequences and were clustered into functional categories. The largest expressed categories were related to primary metabolism, stress response, and protein synthesis. Electronic Northern analysis revealed that stress-related proteins and cell wall modification-related enzymes strongly increased during ripening. Among 448 isoproteins (amino acid-level isogenes) detected in the Unigene set, 186 (42%) displayed significant homologies in their coding regions (nucleic acid-level isogenes). |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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