Busca por genes diferencialmente expressos em resposta a indução de hipertrofia ventricular em rato (Rattus norvegicus) atraves da tecnica de microarranjos de DNA
| Autor: | Ana Carolina Deckmann |
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| Přispěvatelé: | Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães, 1964, Franchini, Kleber Gomes, Boschiero, Antonio Carlos, Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS |
| Jazyk: | portugalština |
| Rok vydání: | 2004 |
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| Zdroj: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) instacron:UNICAMP |
| Popis: | Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Myocardial hypertrophy is one of the major responses to hemodynamic overload imposed by arterial hypertension. This elicits several histological and physiological alterations that affect the performance of the cardiac muscle as a whole. However, little is known about the molecular basis of the process, mainly because its multifactorial and polygenic trait. In this study, the DNA microarrays technique was adopted to identify genes directly involved in the establishment of myocardial hypertrophy. The experiments were based on the production of microarrays from 2304 clones of unknown identity derived from a non-normalized rat heart library. The microarrays were hybridized against cDNA targets synthesized after samples collect at short intervals (1, 3, 6, 12 and 48 hours) following hypertrophy induction by aorta constriction in rats (Rattus norvegicus). The results had confirmed the great potential of microarray technique for identification of differentially expressed genes in response to arterial hypertension, identifying the genes a-MHC, b-MHC and cardiac a-actin, previously described as involved in the process. More interesting, the gene of synaptopodin-2, protein associated with actin cytoskeleton and involved in stress fiber formation in response to mechanical stimuli in podocytes, and the gene of a precursor protein of amyloid beta A4, which is important because of its interaction with a protein that promotes the aggregation of components of MAPK (mitogen-activated protein kinase) cascade in a functional signaling module, were also identified. However, we concluded that it will be essential to utilize normalized libraries to reduce the redundancy of the selected genes, increasing the possibility to find novel genes Abstract: A hipertrofia do miocárdio é uma das principais respostas à sobrecarga hemodinâmica imposta ao coração em um quadro de hipertensão arterial, gerando diversas modificações histofisiológicas que afetam o desempenho do músculo cardíaco como um todo. Entretanto, pouco se sabe sobre a base molecular deste processo, uma vez que esta fisiopatologia possui um caráter poligênico e multicausal. O presente estudo utilizou a técnica de microarranjos de DNA para tentar identificar genes diretamente envolvidos no estabelecimento da hipertrofia cardíaca. Os experimentos basearam-se na produção de microarranjos a partir de 2304 fragmentos de DNA de seqüência desconhecida, provenientes de uma biblioteca não normalizada de ESTs (expressed sequence tags) de coração controle de rato. Esses microarranjos foram hibridados contra amostras de cDNAs sintetizadas a partir do mRNA coletado a intervalos curtos de tempo (1, 3, 6, 12 e 48 horas) após a indução de hipertrofia em ratos (Rattus norvegicus). Os resultados demonstraram que a técnica tem grande potencial para a identificação de genes diferencialmente expressos em resposta à hipertensão cardiovascular, tendo sido identificados os genes a-MHC, _bMHC e a-actina cardíaca, previamente descritos como envolvidos neste processo, bem como os genes da sinaptopodina-2, proteína associada à actina e envolvida na formação de fibras de estresse em resposta à estímulo mecânico em podócitos, não descrito anteriormente como expresso neste tecido, e da proteína precursora de amilóide beta A4, importante porque atua sobre uma proteína que promove a agregação de componentes da cascata das MAPKs (mitogen activated protein kinase) para formar um módulo sinalizatório funcional. Entretanto, observou-se que será essencial usar bibliotecas normalizadas para reduzir a redundância dos genes selecionados e aumentar a possibilidade de encontrar genes novos Mestrado Bioquímica Mestre em Biologia Funcional e Molecular |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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