GENETSKA DIFERENCIJACIJA I MOLEKULARNA FILOGENETIKA AFRIČKOG SOMA IZ TRI RAZLIČITE VODE

Autor: Omoniyi Michael Popoola
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2022
Předmět:
Zdroj: Croatian Journal of Fisheries : Ribarstvo
Volume 80
Issue 3
ISSN: 1848-0586
1330-061X
Popis: The population structure and genetic variability of North African catfish Clarias gariepinus (Burchell 1822) were investigated using partial mitochondrial DNA cytochrome b region sequences. Fifty-four (54) samples were investigated from three geographically isolated rivers in Nigeria. The analysis of 53 haplotypes revealed greater haplotype diversity (0.99930) and nucleotide diversity (p) (0.07270). According to an analysis of molecular variance (AMOVA), the genetic diversity of North African catfish within populations is significantly higher than the genetic diversity across populations. The FST scores (0.75000, 0.94792 and 0.95699) indicated that North African catfish populations in three Nigerian freshwater bodies had a strong genetic structure. The phylogenetic reconstruction of unique haplotypes revealed the placement of a haplotype (Ogbese) linked by others from all three groups with a point mutation ranging from 1 to 24 nucleotides. North African catfish populations in the Asejire and Ureje are genetically diverse, as evidenced by a high level of haplotype diversity of 1.0000, low nucleotide diversity spanning from 0.05101 to 0.07889, and high FST values (within-population genetic variation). The common haplotypes between some populations and mixes of haplotypes from different populations within the same genetic cluster demonstrate that the population genetic structure is not distinct.
Populacijska struktura i genetska varijabilnost afričkog soma istražena je korištenjem djelomičnih sekvenci mitohondrijske DNA citokroma b. Pedeset četiri (54) uzorka su istražena iz tri zemljopisno izolirane rijeke u Nigeriji. Analiza 53 haplotipa pokazala je veću raznolikost haplotipova (0,99930) i nukleotidnu raznolikost (p) (0,07270). Prema analizi molekularne varijance (AMOVA), genetska raznolikost afričkog soma unutar populacija značajno je veća od genetske raznolikosti među populacijama. FST rezultati (0,75000, 0,94792 i 0,95699) pokazuju da populacije afričkog soma u tri nigerijska slatkovodna tijela imaju snažnu genetsku strukturu. Filogenetska rekonstrukcija jedinstvenih haplotipova otkrila je postavljanje haplotipa (Ogbese) povezanog s drugima iz sve tri skupine točkastom mutacijom u rasponu od 1 do 24 nukleotida. Populacije afričkog soma u rijekama Asejire i Ureje genetski su raznolike, što dokazuje visoka razina raznolikosti haplotipa od 1,0000, niska raznolikost nukleotida u rasponu od 0,05101 do 0,07889, te visoke vrijednosti FST-a (genetske varijacije unutar populacije). Zajednički haplotipovi između nekih populacija i mješavine haplotipova iz različitih populacija unutar istog genetskog klastera pokazuju da se genetska struktura populacija ne razlikuje.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: