Modeling citrus huanglongbing data using a zero-inflated negative binomial distribution
| Autor: | José Walter Pedroza Carneiro, Eudmar Almeida, Vanderly Janeiro, William Mário de Carvalho Nunes, Fabio Mulati, Terezinha Aparecida Guedes |
|---|---|
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: |
0106 biological sciences
Candidatus Liberibacter efeito aleatório mixed model Agriculture (General) Negative binomial distribution Distribution (economics) algoritmo EM 01 natural sciences BLUP method modelo misto S1-972 010104 statistics & probability EM algorithm Statistics 0101 mathematics Mathematics biology business.industry 5.01.02.00-1 Statistical model biology.organism_classification Random effects model random effect método BLUP Orchard business 1.02.03.00-1 Agronomy and Crop Science Zero inflated negative binomial 010606 plant biology & botany |
| Zdroj: | Acta Scientiarum: Agronomy, Vol 38, Iss 3 (2016) Acta Scientiarum. Agronomy, Volume: 38, Issue: 3, Pages: 299-306, Published: SEP 2016 Acta Scientiarum. Agronomy; Vol 38 No 3 (2016); 299-306 Acta Scientiarum. Agronomy; v. 38 n. 3 (2016); 299-306 Acta Scientiarum. Agronomy Universidade Estadual de Maringá (UEM) instacron:UEM |
| ISSN: | 1807-8621 1679-9275 |
| Popis: | Zero-inflated data from field experiments can be problematic, as these data require the use of specific statistical models during the analysis process. This study utilized the zero-inflated negative binomial (ZINB) model with the log- and logistic-link functions to describe the incidence of plants with Huanglongbing (HLB, caused by Candidatus liberibacter spp.) in commercial citrus orchards in the Northwestern Parana State, Brazil. Each orchard was evaluated at different times. The ZINB model with random effects in both link functions provided the best fit, as the inclusion of these effects accounted for variations between orchards and the numbers of diseased plants. The results of this model show that older plants exhibit a lower probability of acquiring HLB. The application of insecticides on a calendar basis or during new foliage flushes resulted in a three times larger probability of developing HLB compared with applying insecticides only when the vector was detected. RESUMO. Em diversas áreas do conhecimento, dados com excesso de zeros são encontrados com frequência. Para a análise de tais dados, é recomendado utilizar modelos que permitam uma contagem deste excesso de zero de forma adequada. Neste artigo, o modelo binomial negativo inflacionado de zero (ZINB) foi utilizado para descrever o número de plantas doentes, acometidas por Huanglongbing, em pomares comercias de laranjeiras na região noroeste do Estado do Paraná. Entretanto, deve-se levar em consideração que cada pomar foi avaliado ao longo do tempo, sendo assim, neste contexto, o modelo ZINB com efeito aleatório em ambas as funções de ligação, logarítmica e logística, apresentou melhor ajuste aos dados, pois a introdução destes efeitos consideraram as variações entre os pomares e a dependência entre número de plantas doentes. A partir deste modelo é possível perceber que as plantas mais velhas tendem a apresentar menor probabilidade de adquirir a doença. Todavia, a aplicação de inseticidas e o manejo por calendário apresentam três vezes mais chance de apresentar a doença do que o manejo somente pela presença do vetor. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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