Diversity and ecological footprint of Global Ocean RNA viruses
Autor: | Dominguez-Huerta, Guillermo, Zayed, Ahmed, Wainaina, James, Guo, Jiarong, Tian, Funing, Pratama, Akbar Adjie, Bolduc, Benjamin, Mohssen, Mohamed, Zablocki, Olivier, Pelletier, Eric, Delage, Erwan, Alberti, Adriana, Aury, Jean-Marc, Carradec, Quentin, da Silva, Corinne, Labadie, Karine, Poulain, Julie, Bowler, Chris, Eveillard, Damien, Guidi, Lionel, Karsenti, Eric, Kuhn, Jens, Ogata, Hiroyuki, Wincker, Patrick, Culley, Alexander, Chaffron, Samuel, Sullivan, Matthew |
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Přispěvatelé: | Department of Microbiology [Columbus], Ohio State University [Columbus] (OSU), Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans (GOSEE), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Aix Marseille Université (AMU)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université de Toulon (UTLN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Nord])-Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay (ENS Paris Saclay)-European Molecular Biology Laboratory (EMBL)-École Centrale de Nantes (Nantes Univ - ECN), Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Université australe du Chili, Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-École Centrale de Nantes (Nantes Univ - ECN), Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes université - UFR des Sciences et des Techniques (Nantes univ - UFR ST), Nantes Université - pôle Sciences et technologie, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Sciences et technologie, Nantes Université (Nantes Univ), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Combinatoire et Bioinformatique (LS2N - équipe COMBI), Nantes Université (Nantes Univ)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Integrated Research Facility at Fort Detrick (IRF-Frederick), National Institute of Allergy and Infectious Diseases [Bethesda] (NIAID-NIH), National Institutes of Health [Bethesda] (NIH)-National Institutes of Health [Bethesda] (NIH), Institute for Chemical Research, Kyoto University, Département de Biochimie, de Microbiologie et de Bio-informatique, Université Laval, Université Laval [Québec] (ULaval), Department of Civil, Environmental and Geodetic Engineering [Columbus] |
Jazyk: | angličtina |
Rok vydání: | 2022 |
Předmět: |
Multidisciplinary
Virome Oceans and Seas [SDV.BBM.MN]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry Molecular Biology/Molecular Networks [q-bio.MN] Plankton [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM] Carbon Cycle [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology environment/Ecosystems [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN] RNA Viruses Seawater [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology Ecosystem [SDV.EE.IEO]Life Sciences [q-bio]/Ecology environment/Symbiosis |
Zdroj: | Science Science, 2022, 376 (6598), pp.1202-1208. ⟨10.1126/science.abn6358⟩ |
ISSN: | 0036-8075 1095-9203 |
Popis: | International audience; DNA viruses are increasingly recognized as influencing marine microbes and microbe-mediated biogeochemical cycling. However, little is known about global marine RNA virus diversity, ecology, and ecosystem roles. In this study, we uncover patterns and predictors of marine RNA virus community- and “species”-level diversity and contextualize their ecological impacts from pole to pole. Our analyses revealed four ecological zones, latitudinal and depth diversity patterns, and environmental correlates for RNA viruses. Our findings only partially parallel those of cosampled plankton and show unexpectedly high polar ecological interactions. The influence of RNA viruses on ecosystems appears to be large, as predicted hosts are ecologically important. Moreover, the occurrence of auxiliary metabolic genes indicates that RNA viruses cause reprogramming of diverse host metabolisms, including photosynthesis and carbon cycling, and that RNA virus abundances predict ocean carbon export. |
Databáze: | OpenAIRE |
Externí odkaz: |