Shared genetic predisposition in rheumatoid arthritis-interstitial lung disease and familial pulmonary fibrosis

Autor: Steven Gazal, Hilario Nunes, Jean Sibilia, Christelle Ménard, Aurélien Justet, Philippe Dieudé, Isabelle Callebaut, Amélie Bonnefond, Martin Soubrier, Patrick Revy, Catherine Boileau, Pierre-Antoine Juge, Thierry Schaeverbeke, Aline Frazier, Nathalie Saidenberg, Sébastien Ottaviani, Nadia Nathan, Bruno Crestani, Christophe Béroud, Baptiste Coustet, Vincent Cottin, Lidwine Wemeau-Stervinou, Jean-Pierre Desvignes, Marie-Christophe Boissier, Florence Dastot-Le Moal, Serge Amselem, Philippe Froguel, Yannick Allanore, Annick Clement, Olivier Sand, Gabriel Thabut, Marie-Pierre Debray, Pascal Richette, Caroline Kannengiesser, Benoit Wallaert, Christophe Richez, Dominique Valeyre, Sylvain Marchand-Adam, Huguette Lioté, Nicolas Leulliot, René-Marc Flipo, Raphael Borie, Claire Dromer, David Salgado
Přispěvatelé: Service de Rhumathologie, Hôpital Bichat - Claude Bernard, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Service de Pneumologie, Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), UMR 1152, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Génétique, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), UMR 1149, Centre de Recherches sur l'Inflammation, Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] (EEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Plateforme de génomique constitutionnelle, Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie [CHU LIlle], Pole Cardio-vasculaire et pulmonaire [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Université de Lille, Service de Radiologie, Hospices Civils de Lyon (HCL), UMR 1100, Université Francois Rabelais [Tours], Physiopathologie des maladies génétiques d'expression pédiatrique, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de Rhumatologie, CH Belfort-Montbéliard, UMR 5164, Immuno ConcEpT Lab, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB), Sorbonne Université (SU), Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest]), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques (LCRB - UMR 8015), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université de Lille, Droit et Santé, Institut Européen de Génomique du Diabète - European Genomic Institute for Diabetes - FR 3508 (EGID), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 1132, Service de Rhumatologie, Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Metabolic functional (epi)genomics and molecular mechanisms involved in type 2 diabetes and related diseases - UMR 8199 - UMR 1283 (EGENODIA (GI3M)), Department of Genomics of Common Diseases, Imperial College London, Service Rhumatologie A, Hôpital Cochin [AP-HP], Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Imagerie, service de Rhumatologie, Centre Hospitalier Universitaire de Lille (CHU de Lille), Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques (LGMR), Université Montpellier 1 (UM1)-IFR3, Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service Rhumatologie, Hôpital La Rabta [Tunis], FMTS, CRHI, Laboratoire Immunologie Rhumatologie Moléculaire, Université de Strasbourg (UNISTRA), Fédération Hospitalo-Universitaire OMICARE, Rétrovirus et Pathologie Comparée (RPC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Maladie Pulmonaires Rares, Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], UMR U1125 Service rhumatologie, service de rhumatologie, CHU Clermont-Ferrand, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Hôpital Avicenne [AP-HP], service de génétique, Societe Francaise de Rhumatologie, Club Rhumatismes Inflammation, la Chancellerie des Universites de Paris (legs Poix), Sorbonne Paris Cite (FPI-SPC Program), Agence Nationale de la Recherche ANR-10-LABX-46 ANR-10-EQPX-07-01 ANR-14-CE10-0006 ANR-10-INBS-09, France Genomique National Infrastructure, Pfizer, Chugai, Centre de Resources Biologiques Hopital Bichat Paris France, ANR-14-CE10-0006,GENEXGERTEL,Rôles génomiques et extragénomiques de RTEL1(2014), Hôpital Bichat - Claude Bernard, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris ( AP-HP ), Université Paris Diderot (Paris 7), Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] ( CHLS ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Saint-Etienne, UMR 1137, Fac Sci, Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Service de Pneumologie Pédiatrique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Pierre et Marie Curie (Paris 6), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Bordeaux ( UB ), Sorbonne Universités, Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie ( IMPMC ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Ouest] ), Muséum National d’Histoire Naturelle ( MNHN ), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques ( LCRB - UMR 8015 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Université Droit et Santé (Lille 2) ( UDSL ), European Genomic Institute for Diabetes ( EGID ), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle ( GMGF ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Hôpital Lariboisière, Génomique Intégrative et Modélisation des Maladies Métaboliques ( EGID ), Université de Lille-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), CHU Cochin [AP-HP], Institut Cochin ( UM3 (UMR 8104 / U1016) ), Centre Hospitalier Universitaire de Lille ( CHU de Lille ), Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -IFR3-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Montpellier ( UM ), Hôpital La Rabta [Tunis), Université de Strasbourg ( UNISTRA ), Rétrovirus et Pathologie Comparée ( RPC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ), Département Génétique, Institut de l'Elevage, Centre Reference Maladies Respiratoires Rares, Hôpital Armand Trousseau, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris ( AP-HP ), Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne ( UNH ), Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne ( CRNH d'Auvergne ), Hôpital Avicenne, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris ( AP-HP ), European Genomic Institute for Diabetes - FR 3508 (EGID), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Metabolic functional (epi)genomics and molecular mechanisms involved in type 2 diabetes and related diseases - UMR 8199 - UMR 1283 (GI3M), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École pratique des hautes études (EPHE), Institut de l'élevage (IDELE), ProdInra, Archive Ouverte, Centre de référence national pour les maladies respiratoires rares de l’enfant RespiRare [CHU Trousseau], Service de Pneumologie pédiatrique [CHU Trousseau], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de génétique et embryologie médicales [CHU Trousseau], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Trousseau [APHP], Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), European Genomic Institute for Diabetes [Lille] (EGID), Génomique Intégrative et Modélisation des Maladies Métaboliques (EGID), Université de Lille-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Hôpital Armand Trousseau, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Hôpital Avicenne, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, IFR3, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2017
Předmět:
Male
Pathology
medicine.disease_cause
Arthritis
Rheumatoid
0302 clinical medicine
Risk Factors
Pulmonary fibrosis
Exome
Telomerase
Exome sequencing
Mutation
[SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Interstitial lung disease
Middle Aged
3. Good health
Europe
Polyarthrite rhumatoïde
maladie pulmonaire
Phenotype
Rheumatoid arthritis
Female
Pulmonary and Respiratory Medicine
Adult
medicine.medical_specialty
Heterozygote
fibrose pulmonaire
03 medical and health sciences
[ SDV.MHEP ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
medicine
Genetic predisposition
Humans
Genetic Predisposition to Disease
respiratory system diseases
Genetic Association Studies
Aged
030203 arthritis & rheumatology
pulmonary fibrosis
business.industry
Case-control study
DNA Helicases
Sequence Analysis
DNA
medicine.disease
030228 respiratory system
Case-Control Studies
Immunology
business
Lung Diseases
Interstitial
Software
[SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Zdroj: European Respiratory Journal
European Respiratory Journal, 2017, 49 (5), ⟨10.1183/13993003.02314-2016⟩
European Respiratory Journal, European Respiratory Society, 2017, 49 (5), 〈10.1183/13993003.02314-2016〉
European Respiratory Journal, European Respiratory Society, 2017, 49 (5), ⟨10.1183/13993003.02314-2016⟩
ISSN: 0903-1936
1399-3003
DOI: 10.1183/13993003.02314-2016⟩
Popis: Despite its high prevalence and mortality, little is known about the pathogenesis of rheumatoid arthritis-associated interstitial lung disease (RA-ILD). Given that familial pulmonary fibrosis (FPF) and RA-ILD frequently share the usual pattern of interstitial pneumonia and common environmental risk factors, we hypothesised that the two diseases might share additional risk factors, including FPF-linked genes. Our aim was to identify coding mutations of FPF-risk genes associated with RA-ILD.We used whole exome sequencing (WES), followed by restricted analysis of a discrete number of FPF-linked genes and performed a burden test to assess the excess number of mutations in RA-ILD patients compared to controls.Among the 101 RA-ILD patients included, 12 (11.9%) had 13 WES-identified heterozygous mutations in the TERT, RTEL1, PARN or SFTPC coding regions. The burden test, based on 81 RA-ILD patients and 1010 controls of European ancestry, revealed an excess of TERT, RTEL1, PARN or SFTPC mutations in RA-ILD patients (OR 3.17, 95% CI 1.53–6.12; p=9.45×10−4). Telomeres were shorter in RA-ILD patients with a TERT, RTEL1 or PARN mutation than in controls (p=2.87×10−2).Our results support the contribution of FPF-linked genes to RA-ILD susceptibility.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: