Meet-U: educating through research immersion
| Autor: | Anne Lopes, Laurent David, Sophie Sacquin-Mora, Alexandre Albani, Marc Delarue, Vasiliki Myrodia, Eric Anthony, Mélissa Cardon, Hugo Schweke, Nicolas Sompairac, Stéphane Le Crom, Christine Froidevaux, Patrick F.J. Fuchs, Pierre Poulain, Violaine Verrecchia, Jeanne Laurentie, Nadège Guiglielmoni, Raphael Guerois, Martin Weigt, Maria Ruiz-Cuevas, Juliana S Bernardes, Samer Abboud, Rémi Montagne, Nathalie Lehmann, Vaitea Opuu, Chloé Quignot, Agnes Baud, Camille Lochard, Chloé Dequeker, Samia Djerroud, Romain Conte, Elodie Laine, Dariusz Czernecki, Olivier Lespinet, Mariam Sissoko, Agathe Delaune, Guillaume Bouvier, Arnaud Ferré, Audrey Vallerix, Robert Clerc, Hugues Richard, Alessandra Carbone, Elise Parey, Sylvain Privé, Pauline Fourgoux, Nika Abdollahi, Yann Ponty, Lélia Polit, Gaëlle Lelandais |
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| Přispěvatelé: | Sorbonne Universités, Université Paris-Saclay, Dynamique structurale des Macromolécules / Structural Dynamics of Macromolecules, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assemblage moléculaire et intégrité du génome (AMIG), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau] (LIX), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École polytechnique (X), Algorithms and Models for Integrative BIOlogy (AMIBIO), Inria Saclay - Ile de France, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Laboratoire de biochimie théorique [Paris] (LBT (UPR_9080)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de biologie physico-chimique (IBPC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Biologie Computationnelle et Quantitative = Laboratory of Computational and Quantitative Biology (LCQB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Recherche en Informatique (LRI), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bioinformatique structurale, Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas] (MaIAGE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Dynamique des Structures et Interactions des Macromolécules Biologiques (DSIMB), Biologie Intégrée du Globule Rouge (BIGR (UMR_S_1134 / U1134)), Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Université des Antilles (UA)-Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Université des Antilles (UA), Institut de biologie physico-chimique (IBPC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de biologie physico-chimique (IBPC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles (UA)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Université de La Réunion (UR)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles (UA)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Université de La Réunion (UR)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS), GenomiqueENS (Genomique ENS), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Biologie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genetic Networks [LCQB] (LCQB-GN), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie physico-chimique (IBPC (FR_550)), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Analyse des Données à Haut Débit en Génomique (ADHDG), Evolution Paris Seine, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bioinformatique structurale - Structural Bioinformatics, Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles (UA)-Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles (UA), Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Masters of Computer Science and of Molecular and Cellular Biology at Sorbonne Université / UPMC (Bioinformatics and Modeling specialty), Master of Analysis, Modeling and Engineering of Biological and Medical Information at Université Paris-Saclay, Groupement de Recherche BioInformatique Moléculaire, Société Française de BioInformatique, Ecole Doctorale Structure et Dynamique des Systèmes Vivants, Institut de Biologie Paris Seine, Institut Universitaire de France, Biochimie Structurale, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau] ( LIX ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École polytechnique ( X ), Algorithms and Models for Integrative BIOlogy ( AMIBIO ), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ), Laboratoire de biochimie théorique [Paris] ( LBT ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Biologie Computationnelle et Quantitative = Laboratory of Computational and Quantitative Biology ( LCQB ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Laboratoire de Recherche en Informatique ( LRI ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Biologie Paris Seine ( IBPS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas] ( MaIAGE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Dynamique des Structures et Interactions des Macromolécules Biologiques ( DSIMB ), Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] ( INTS ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut de biologie physico-chimique ( IBPC ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de biologie physico-chimique (IBPC (FR_550)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), CentraleSupélec-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université de Paris (UP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laine, Elodie, Lopes, Anne |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2018 |
| Předmět: |
0301 basic medicine
Research design [SDV]Life Sciences [q-bio] Social Sciences Cloud computing Biochemistry Computational biology Database and Informatics Methods Sociology Jury Nothing ComputingMilieux_COMPUTERSANDEDUCATION Macromolecular Structure Analysis Biology (General) media_common Schools Ecology 4. Education Professions Computational Theory and Mathematics Research Design Modeling and Simulation Lectures Engineering ethics Computer and Information Sciences Universities QH301-705.5 Bioinformatics media_common.quotation_subject Research and Analysis Methods Education 03 medical and health sciences Cellular and Molecular Neuroscience [ INFO.INFO-BI ] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] Genetics Humans Students Molecular Biology Ecology Evolution Behavior and Systematics business.industry Research Biology and Life Sciences Proteins Teachers Coopetition Computing Methods 030104 developmental biology Protein structure prediction People and Places Protein structure Population Groupings [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] business |
| Zdroj: | PLoS Computational Biology PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2018, 14 (3), pp.1-10. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005992⟩ PLoS Computational Biology, 2018, 14 (3), pp.e1005992. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005992⟩ PLoS Computational Biology, 2018, 14 (3), pp.1-10. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005992⟩ PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2018, pp.1-10. 〈10.1371/journal.pcbi.1005992〉 Plos Computational Biology 3 (14), 1-10. (2018) PLoS Computational Biology, Vol 14, Iss 3, p e1005992 (2018) |
| ISSN: | 1553-734X 1553-7358 |
| Popis: | This is a PLOS Computational Biology Education paper.; International audience; We present a new educational initiative, called Meet-U, that aims at training students to collaborativework in computational biology and at bridging the gap between education and research.Meet-U mimics the set up of collaborative research projects and takes advantage of the most populartools for collaborative work and of cloud computing. Students are grouped in teams of 4-5 peopleand have to realize a project from A to Z that answers a challenging question in Biology.Meet-U promotes "coopetition", as the students collaborate within and across the teams and are also incompetition with each other to develop the best final product.Meet-U fosters interactions between different actors of education and research through the organization of a meeting day, open to everyone, where the students present their work to a jury of researchers and jury members give researchseminars. This very unique combination of education and research is strongly motivating for thestudents and provides a formidable opportunity for a scientific community to unite and increase itsvisibility. We report on our experience with Meet-U in two French universities with master studentsin bioinformatics and modeling, with protein-protein docking as the subject of the course.Meet-U is easy to implement, virtually costs nothing and can be straightforwardly transferred to other fieldsand/or universities. All the information and data are available at http://www.meet-u.org. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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