Fasulye Tohumlarındaki Viral Etmenlerin Saptanmasında Tanı Yöntemlerinin Duyarlılıklarının İncelenmesi

Autor: Kübra Saraçoğlu, Semih Erkan
Rok vydání: 2016
Předmět:
Zdroj: Volume: 53, Issue: 3 309-315
Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi
ISSN: 1018-8851
2548-1207
Popis: Bu çalışma,2012 ve 2013 yıllarında değişik tohum firmalarından ve Ege Üniversitesi ZiraatFakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü’nden temin edilen 70 adet farklı fasulye tohumörneğinde virüslerin bulunma durumunun ve bu virüslerin tanılanmasındakullanılan yöntemlerin duyarlılıklarının belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür.Fasulye tohum örneklerindeki viral etmenlerin tanılanmasında simptomatoloji,bitki yetiştirme, biyolojik testleme (mekanik inokulasyon), seroloji vemoleküler yöntemler kullanılmıştır. Tohum örneklerinde 5 viral etmenin varlığıRT-PCR, 4 virüsün tanılanması ise DAS-ELISA yöntemi ile incelenmiş ve buyöntemlerin diğer yöntemlerle duyarlılık durumu kıyaslanmıştır. Çalışmadakitoplam 70 tohum örneğinin RT-PCR yöntemi ile 69'u, DAS-ELISA yöntemi ile 62'si,mekanik inokulasyon ile 30'ı, tohumdaki belirtilerin görsel olarak incelenmesiile 48'i ve bitki yetiştirme testleri ile 70 tohum örneğinden gelişme gösteren64 bitkiden 48'i enfektelidir. Tohum örneklerinde BCMV, BCMNV, CMV ve SMV adlıviral etmenlerinin olduğu bulunurken, AMV’ne rastlanılmamıştır. Elde edilensonuçlara göre, tanılama yöntemleri arasında RT-PCR' ın en duyarlı yöntemolduğu ve tohum örneklerinin büyük bir kısmının BCMV ile enfekteli bulunduğugörülmüştür.
Thestudy was conducted to find out the presence of viral infections in 70bean seed samples providing from different seed companies and Ege UniversityFaculty of Agriculture Department of Horticulture. In order to determine thesensitivity of the methods used in the detection of viral infections in beanseed samples, the studies carried out in 2012 and 2013 years. To detect theviral infections in bean seed samples; symptomatology, growing-on test,biological test (mechanical inoculation), serological and molecular methodswere used. The presence of 5 viral agents in bean seed samples was checked byRT-PCR, while the diagnosis of other 4 viruses was done with DAS-ELISA.Considering the results obtained, the sensitivity of the methods used in thiswork was investigated for the detection of viruses in bean seed samples. Out of70 bean seed samples, the infection of certain viruses was detected in 69samples by RT-PCR, 62 by DAS-ELISA, 48 by viral examinations and 30 bybiological indexing. In growing-on assays, the viral infections were found in48 of 64 plants developing from 70 seed samples. BCMV, BCMNV, CMV,and SMV were detected in seed samples, while AMV was not found. According to thefindings from this study, it was found that RT-PCR was the most sensitivemethods in the detection of the viruses in bean seed samples and the majorityof bean seed samples was infected with BCMV.
Databáze: OpenAIRE