Nonradioactive Detection of Small RNAs Using Digoxigenin-Labeled Probes

Autor: Ariel Hernán Tomassi, Damián Alejandro Cambiagno, Pablo Andrés Manavella, Delfina Gagliardi
Přispěvatelé: Carbonell, Alberto
Rok vydání: 2017
Předmět:
Zdroj: Methods in Molecular Biology ISBN: 9781493971640
Plant Argonaute Proteins : Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology
DOI: 10.1007/978-1-4939-7165-7_14
Popis: Small RNAs have been traditionally detected and quantified using small RNA blots, a modified Northern blot technique. The small RNAs are size-fractionated from the rest of the cellular RNA molecules by polyacrylamide gel electrophoresis and transferred by blotting onto a positively charged membrane. A radiolabeled probe was then traditionally used to detect a specific small RNA in the cellular pool. Small RNA blotting is a relatively simple, inexpensive approach to visualize small RNAs without artifacts. However, the radioactive labeling of the probe is sometimes an impediment, especially due to the requirement of specialized facilities. Here we describe a sensitive and simple method to detect and quantify small RNAs using digoxigenin-based nonradioactive RNA blots. Fil: Tomassi, Ariel Hernán. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral; Argentina Fil: Gagliardi, Delfina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral; Argentina Fil: Cambiagno, Damián Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral; Argentina Fil: Manavella, Pablo Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral; Argentina
Databáze: OpenAIRE