Graph-Mining Algorithm for the Evaluation of Bond Formability

Autor: Claude Laurenço, Frédéric Pennerath, Gilles Niel, Philippe Jauffret, Amedeo Napoli, Philippe Vismara
Přispěvatelé: SUPELEC-Campus Metz, Ecole Supérieure d'Electricité - SUPELEC (FRANCE), Institut Charles Gerhardt Montpellier - Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux de Montpellier (ICGM ICMMM), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Agents, Apprentissage, Contraintes (COCONUT), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Unité de Gestion de la Chimiothèque Nationale (UGCN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Knowledge representation, reasonning (ORPAILLEUR), INRIA Lorraine, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (LORIA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Université Nancy 2-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Université Nancy 2-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM), Université de Montpellier (UM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Université Nancy 2-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Université Nancy 2-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2010
Předmět:
Zdroj: Journal of Chemical Information and Modeling
Journal of Chemical Information and Modeling, American Chemical Society, 2010, 50 (2), pp.221-239. ⟨10.1021/ci9003909⟩
Journal of Chemical Information and Modeling, 2010, 50 (2), pp.221-239. ⟨10.1021/ci9003909⟩
ISSN: 1549-9596
1549-960X
DOI: 10.1021/ci9003909⟩
Popis: International audience; The formability of a bond in a target molecule is a bond property related to the problem of finding a reaction that synthesizes the target by forming the bond: the easier this problem, the higher the formability. Bond formability provides an interesting piece of information that might be used for selecting strategic bonds during a retrosynthesic analysis or for assessing synthetic accessibility in virtual screening. The article describes a graph-mining algorithm called GemsBond that evaluates formability of bonds by mining structural environments contained in several thousand molecular graphs of reaction products. When tested on reaction databases, GemsBond recognizes most formed bonds in reaction products and provides explanations consistent with knowledge in organic synthesis.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: