Remodeling of the cycling transcriptome of the oyster Crassostrea gigas by the harmful algae Alexandrium minutum
| Autor: | Mohamedou Sow, Jean-Charles Massabuau, Hélène Hégaret, Caroline Fabioux, Damien Tran, Floriane Boullot, Arnaud Huvet, Laura Payton, Claire Hoede, Mickael Perrigault |
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| Přispěvatelé: | Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme Bio-Informatique - Génotoul, Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR ACCUTOX 13-CESA-0019, Plateforme BioInformatique, Genotoul, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2017 |
| Předmět: |
0301 basic medicine
Gill Biotope Oyster DINOFLAGELLATE animal structures Harmful Algal Bloom Science [SDV]Life Sciences [q-bio] MAMMALIAN CIRCADIAN CLOCK DIFFERENTIAL EXPRESSION ANALYSIS PARALYTIC SHELLFISH TOXINS GENE-EXPRESSION SUPRACHIASMATIC NUCLEUS FEEDING RESPONSES MOUSE-LIVER SHIFT WORK RHYTHMS Article Transcriptome 03 medical and health sciences 0302 clinical medicine Algae Circadian Clocks biology.animal Botany Animals 14. Life underwater Crassostrea Ultradian rhythm Multidisciplinary biology fungi food and beverages biology.organism_classification Circadian Rhythm 030104 developmental biology Dinoflagellida Medicine Marine Toxins Entrainment (chronobiology) 030217 neurology & neurosurgery |
| Zdroj: | Scientific Reports (2045-2322) (Nature Publishing Group), 2017-06, Vol. 7, N. 1, P. 3480 (1-14) Scientific Reports Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7, ⟨10.1038/s41598-017-03797-4⟩ Scientific Reports, Vol 7, Iss 1, Pp 1-14 (2017) Scientific Reports (7), . (2017) Scientific Reports, 2017, 7, ⟨10.1038/s41598-017-03797-4⟩ |
| ISSN: | 2045-2322 |
| Popis: | As a marine organism, the oyster Crassostrea gigas inhabits a complex biotope governed by interactions between the moon and the sun cycles. We used next-generation sequencing to investigate temporal regulation of oysters under light/dark entrainment and the impact of harmful algal exposure. We found that ≈6% of the gills’ transcriptome exhibits circadian expression, characterized by a nocturnal and bimodal pattern. Surprisingly, a higher number of ultradian transcripts were also detected under solely circadian entrainment. The results showed that a bloom of Alexandrium minutum generated a remodeling of the bivalve’s temporal structure, characterized by a loss of oscillations, a genesis of de novo oscillating transcripts, and a switch in the period of oscillations. These findings provide unprecedented insights into the diurnal landscape of the oyster’s transcriptome and pleiotropic remodeling due to toxic algae exposure, revealing the intrinsic plasticity of the cycling transcriptome in oysters. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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