АННОТАЦИЯ MALDI-МАСС-СПЕКТРОВ КЛЕТОЧНОЙ БИОМАССЫ ШТАММОВ CANDIDA ALBICANS BERKHOUT
| Rok vydání: | 2022 |
|---|---|
| Předmět: | |
| DOI: | 10.24412/1999-6780-2022-1-41-52 |
| Popis: | В работе представлены данные сравнения масс-листов, получаемых благодаря MALDI-TOF-масс-спектрометрии клеточной биомассы Candida albicans, а также результаты аннотации MALDI-масс-спектров, в которой найдены соответствия между белками и пептидами из протеома данного микромицета и отдельными пиками. Исследовали 12 штаммов C. albicans клинического происхождения. Показано, что штаммы C. albicans имеют различающиеся масс-листы и, как следствие, различающиеся по набору группы спектрообразующих белков и пептидов. Изучены особенности аминокислотного состава этих соединений, показано их своеобразие в сравнении с аминокислотной композицией целой дрожжевой клетки. Отличительные особенности представленной работы в сравнении с ранее опубликованными сообщениями по данному направлению: (1) использование не только коллекционных штаммов, но и первичных изолятов, (2) аннотирование масс-спектров из культур нескольких штаммов с последующим сопоставлением. В работе обоснована возможность применения MALDI-TOF-MS для внутривидового типирования C. albicans, а также опосредованно – в исследовании различий штаммов по выраженности факторов вирулентности. Найдены белки, уникальные для C. albicans и перспективные, таким образом, как «мишени» в создании тест-систем некультуральной диагностики инвазивного кандидоза. The report presents data of comparison of the mass-lists obtained by MALDI-TOF mass-spectrometry of Candida albicans cell biomass, as well as the results of the annotation of MALDI-mass-spectra, in which correspondences between proteins and peptides from the proteome of this micromycete and individual peaks were found. 12 strains of C. albicans of clinical origin were studied. It was shown that C. albicans strains have different mass-lists and, as a result, different groups of specter-forming proteins and peptides. The features of the amino acid composition of these compounds have been studied, their originality has been shown in comparison with the amino acid composition of the whole yeast cells. The dis-tinctive features of the presented work in comparison with previously published reports in this area were: (1) the use of not only collection strains, but also primary isolates, (2) an-notation of mass-spectra from cultures of several strains with subsequent comparison. The report substantiates the possibility of using MALDI-TOF-MS for intraspecific typing of C. albicans, as well as indirectly − in the study of strain differences in the expression of virulence factors. Proteins unique to C. albicans and therefore promising as «targets» for the creation of test-systems for non-cultural diagnostics of invasive candidiasis have been found. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|