РНК СЕКВЕНИРОВАНИЕ ПРИ ПЛОСКОКЛЕТОЧНОМ РАКЕ ПИЩЕВОДА: ОТ ЗАБОРА БИОМАТЕРИАЛА ДО СЕКВЕНИРОВАНИЯ НА HISEQ2000
| Jazyk: | ruština |
|---|---|
| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: | |
| DOI: | 10.34689/sh.2016.18.5.004 |
| Popis: | В Казахстане отмечается высокая заболеваемость плоскоклеточным раком пищевода, частота заболеваемости составляет 10,1:100 000. В структуре смертности рак пищевода среди мужчин – занимает 5-ое, среди женщин – 9-ое место в республике Казахстан. Молекулярные механизмы, способствующие инициации и прогрессированию онкопатологии еще недостаточно изучены. Тем не менее, отсутствие чувствительных и специфичных биомаркеров для диагностики онкозаболеваний подчеркивает необходимость дополнительных исследований по изучению развития канцерогенеза. В этом аспекте перспективным является исследование транскриптомного профиля опухолевых клеток. В работе представлено описание этапов пробоподготовки и РНК секвенирования на основе технологии секвенирования нового поколения. Каждый этап от момента забора биоматериала, выделения тотальной РНК, подготовка библиотеки оказывают влияние на получение качественных данных при последующем секвенировании. The squamous esophageal cancer is a disease which is highly frequent in Kazakhstan, the frequency of the disease is 10,1:100 000. In the mortality structure esophageal cancer takes place among men the 5th place, among women the 9th place in the Republic of Kazakhstan. The molecular mechanisms which contribute to the initiation and progression of the cancer pathology are not investigated enough. Nevertheless, the lack of the sensitive and specific biomarkers for the diagnosis of the cancer diseases, underlines about the necessity of the additional research works to study about the development of carcinogenesis. Investigation of the transcriptome profile of tumor cells is perspective in this aspect of the study. The paper describes the stages of the sample preparation and sequencing of RNA, based on a new generation sequencing technology. Each step from the moment of the sampling of biological material, isolation of total RNA, preparation of libraries have an impact on obtaining of the high-quality data in subsequent sequencing. Қазақстанда өңештің жалпақклеткалық ісігіне шалдығудың жоғары деңгейі тіркелуде, ауруға шалдығу жиілігі 100000 адамға шаққанда шамамен 10,1 көрсеткішті құрайды. Осы ауру Қазақстан Республикасында ерлер арасындағы өлім бойынша 5-ші, ал әйелдер арасында 9-шы орын алады. Онкопатологияның инициациясы мен прогрессиясын қоздыратын молекулалық механизмдер әлі толықтай зерттелмеген. Осыған қоса, онкоауруларды диагностикалаудың сезімтал әрі специфкалық биомаркерлердің тапшылығы қ\канцерогенез дамуына бағытталған қосымша зерттеулерді қажет етеді. Осы аспектіде ісік клеткаларының транскриптомдық профильдерін зерттеу үмітті тәсіл болып отыр. Жұмыста үлгілерді дайындау мен жаңа буынды секвенирлеу технологиясы негізіндегі РНҚ секвенирлеу қадамдары сипатталған. Биоматериалды жинаудан бастап, тотальдық РНҚ-ны бөліп алу мен кітапханаларды дайындау сапасы келешектегі секвенирлеу кезінде алынған мәліметтер сапасына әсер етеді. Наука и здравоохранение, Выпуск 5 (18) 2016 |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|