A Retrospective next Generation Sequencing-based Virulome Analysis of the First VanA-type Enterococcus faecalis Clinical Isolate from Bulgaria
| Autor: | Slavil Peykov, Georgieva, Dimitrina, Dimov, Svetoslav, Strateva, Tanya |
|---|---|
| Rok vydání: | 2022 |
| Předmět: | |
| DOI: | 10.24412/2707-6180-2022-64-216-219 |
| Popis: | In this study, we report the results from a retrospective next generation sequencing-based virulome analysis of the first VanA-type Enterococcus faecalis clinical isolate from Bulgaria. This strain was obtained from an 84-year-old female patient with clinical symptoms of urinary tract infection that started one week before the date of hospitalization. The vanA gene and its genetic environment are already identified; thus the whole-genome sequencing approach presented here is focused on the detection of the genes that contribute to the virulence of this isolate. В этом исследовании мы сообщаем о результатах ретроспективного анализа вирулома на основе секвенирования нового поколения первого клинического изолята Enterococcus faecalis типа VanA из Болгарии. Этот штамм был получен от 84-летней пациентки с клиническими симптомами инфекции мочевыводящих путей, начавшейся за неделю до госпитализации. Ген VanA и его генетическое окружение уже идентифицированы. Таким образом, представленный здесь подход к секвенированию всего генома направлен на обнаружение генов, которые способствуют вирулентности этого изолята. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|