НОВЫЕ МАСС СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ ДЛЯ ВНУТРИВИДОВОГО ТИПИРОВАНИЯ ШТАММОВ CANDIDA AURIS
| Rok vydání: | 2023 |
|---|---|
| Předmět: | |
| DOI: | 10.24412/1999-6780-2023-2-11-18 |
| Popis: | Цель исследования: предложить и опробовать масс-спектрометрические маркеры различной дискриминационной силы для внутривидового типирования Candida auris. Приведен опыт внутривидового типирования C. auris с использованием методов молекулярной генетики, обосновано применение MALDI-TOF-масс-спектрометрии для решения той же задачи. Для достижения поставленной цели дополнен «масс-спектрометрический банк данных» штаммов C. auris, в ходе данного сегмента исследования предложен простой прием для совершенствования пробоподготовки культур. Поиск кандидатных маркеров для внутривидового типирования провели на масс-спектрах колоний из уринокультуры C. auris, полученной на хромогенной среде. Составлена комплексная масс-спектрометрическая характеристика «дочерних» штаммов из уринокультуры по 10 показателям. Благодаря сравнительному анализу MALDI-масс-спектров предложено 2 масс-спектрометрических маркера: пик 12330 Da и сигнал в интервале 4060-4400 Da. Данные маркеры испытаны на 3-х выборках MALDI-масс-спектров C. auris. The purpose of the study is to propose and assay the mass-spectrometric markers with various discriminatory strengths for intraspecific typing of Candida auris. The experience of intraspecific typing of C. auris using the methods of molecular genetics is presented; the use of MALDI-TOF-mass-spectrometry for solving the same problem is sub-stantiated. To achieve this goal, the «mass spectrometric data bank» of C. auris strains was supplemented; in the course of this segment of the study, a simple technique was proposed to improve the sample preparation of cultures. The search for candidate markers for intraspecific typing was carried out on the mass-spectra of colonies from C. auris urine culture obtained on a chromogenic medium. Comprehensive mass-spectrometric characteristics of «daughter» strains of urine culture for 10 indicators was compiled. Due to comparative analysis of MALDI-mass-spectra, 2 mass-spectrometric markers were proposed: a peak at 12330 Da and a signal in the range of 4060-4400 Da. These markers were tested on 3 sets of MALDI-mass-spectra of C. auris. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|