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Nous presentons une etude par RMN et modelisation moleculaire sur deux duplexes d'ADN contenant une lacune de un nucleotide. La difference entre les deux oligonucleotides reside dans la base centrale en face de la lacune, une guanine ou une cytosine. Pour le duplex appele gapG, nous observons en solution une helice de type B dans laquelle la guanine est empilee a l'interieur de l'helice. Dans le cas du duplex gapC, nous montrons l'existence de deux formes, l'une ou la cytosine est a l'interieur de l'helice; la seconde ou la cytosine est extra helicale. We report NMR and molecular modelling studies on two DNA duplexes containing a gap of one nucleotides. The difference between the two oligonucleotides lies in the central base face to the gap, a guanine or a cytosine. For the gapG, we observed in solution a B-form conformation where the guanine stacks in the helix. For the gapC, we reveal the existence of two species, one majority where the cytosine is inside the helix and a second for which the cytosine is extrahelical. |
