Cinq ans d’inventaires des Bivalves de France par analyse de l’ADN environnemental : quelles conclusions, quelles perspectives ?

Autor: Florent Lamand, Pierre Taberlet, Mathieu Rocle, Nicolas Roset, Pauline Jean, Xavier Cucherat, Alice Valentini, Gaëlle Jardin, Stéphanie Couprie, Emilie Breugnot, Thibault Vigneron, Tony Dejean, Jean-Baptiste Decotte, Vincent Prié
Rok vydání: 2021
Zdroj: Naturae.
ISSN: 2553-8756
DOI: 10.5852/naturae2021a8
Popis: Les inventaires d’espèces dulçaquicoles par analyse de l’ADN environnemental (ADNe) se sont développés depuis une dizaine d’années. Nous présentons ici l’application de cette méthode à l’inventaire des Bivalves d’eau douce de France. De 2015 à 2018, nous avons réalisé plusieurs tests de terrain en France, en choisissant différentes conditions environnementales. Nous avons comparé les résultats des analyses ADNe avec les connaissances sur la répartition des Bivalves à l’échelle de la France métropolitaine, à l’échelle des bassins-versants de la Meuse et du Rhône, et avec des sites ayant fait l’objet d’inventaires poussés, impliquant plusieurs malacologues utilisant les méthodes traditionnelles (observations au bathyscope, plongée hyperbare, tri de sédiment). Nos résultats montrent l’efficacité des analyses d’ADNe pour la détection et la distinction de presque tous les taxons de Bivalves dulçaquicoles de France (à l’exception des différentes espèces de Corbicules et des sous-espèces de la Mulette méridionale Unio mancus Lamarck, 1819). La méthode est commercialisée depuis 2018 et notre base de données comporte fin 2020 plus de 300 sites inventoriés par analyse de l’ADNe. L’analyse de ces résultats montre que certaines espèces peu étudiées, en particulier des espèces des écosystèmes de l’aval, souffrent d’extinctions locales en France. Ils plaident en faveur de la mise en œuvre d’actions de conservation en particulier pour la Cyclade des fleuves Sphaerium solidum (Normand, 1844), la Grande Cyclade Sphaerium rivicola (Lamarck, 1818) et l’Anodonte comprimée Pseudanodonta complanata (Rossmässler, 1835).
Databáze: OpenAIRE