Aetiology of community-acquired pneumonia in hospitalized adult patients in New Caledonia

Autor: Paul M. V. Martin, Hervé Levenes, Sylvain Mermond, Francine Baumann, Alain Berlioz-Arthaud, M. Estivals
Rok vydání: 2010
Předmět:
Zdroj: Tropical Medicine & International Health. 15:1517-1524
ISSN: 1360-2276
DOI: 10.1111/j.1365-3156.2010.02653.x
Popis: Summary Objective To describe the aetiology of community-acquired pneumonia (CAP) in hospitalized adult patients in New Caledonia, a French archipelago in the South Pacific. Methods Confirmed CAP patients (n = 137) were enrolled prospectively. Pathogens were detected by culture, molecular methods, serology on paired sera, immunofluorescence on nasopharyngeal swabs and antigen detection in urine. Results The aetiology of CAP was determined in 82 of 137 cases (59.8%), of which 31 exhibited two or more pathogens (37.8%). Hundred and seventeen pathogens were detected: Streptococcus pneumoniae was the most common one (41.0%), followed by influenza virus A (22.1%) and Haemophilus influenzae (10.2%). The frequency of atypical bacteria was low (6.0%). The most frequent and significant coinfection was S. pneumoniae with influenza A virus (P = 0.004). Influenza virus was detected from nasopharyngeal swabs in four patients (15.4% of patients tested for influenza) and by PCR from pulmonary specimens in 15 patients (57.7%). Conclusions Streptococcus pneumoniae is the leading cause of CAP in New Caledonian adults. Viral–bacterial co-infections involving S. pneumoniae and influenza virus are very common during the winter. Such adult patients hospitalized with CAP are a clear sentinel group for surveillance of influenza. Vaccination against influenza and S. pneumoniae should be strengthened when risk factors are identified. Etiologie de la pneumonie communautaire chez les patients adultes hospitalises en Nouvelle-Caledonie Objectif: Decrire l’etiologie de la pneumonie communautaire (PC) chez les patients adultes hospitalises en Nouvelle-Caledonie, un archipel francais dans le sud du Pacifique. Methodes: Les patients confirmes PC (n = 137) ont ete recrutes de facon prospective. Les agents pathogenes ont ete detectes par culture, methodes moleculaires, serologie sur des paires de serums, immunofluorescence sur des prelevements du nasopharynx et detection d’antigene dans les urines. Resultats: L’etiologie de la PC a ete determinee chez 82 des 137 cas (59,8%) dont 31 presentaient deux ou plusieurs agents pathogenes (37,8%). 117 agents pathogenes ont ete detectes: Streptococcus pneumoniaeetait le plus courant (41,0%), suivi par le virus influenza A (22,1%) et Haemophilus influenzae (10,2%). La frequence des bacteries atypiques etait faible (6,0%). La coinfection la plus frequente et importante etait celle avec S. pneumoniae et le virus de l’influenza A (p = 0,004). Le virus de l’influenza a ete detecte dans des prelevements nasopharynges chez 4 patients (15,4% des patients testes pour l’influenza) et par PCR a partir de prelevements pulmonaires chez 15 patients (57,7%). Conclusions: S. pneumoniae est la principale cause de PC chez les adultes de Nouvelle-Caledonie. Les coinfections viro-bacteriennes impliquant S. pneumoniae et le virus de l’influenza sont tres frequentes pendant l’hiver. De tels patients adultes hospitalises avec une PC sont un groupe sentinelle claire pour la surveillance de l’influenza. La vaccination contre l’influenza et S. pneumoniae devrait etre renforcee lorsque les facteurs de risque sont identifies. Mots-cles: etiologie, pneumonie communautaire, Nouvelle-Caledonie, virus influenza, PCR. Etiologia de la neumonia adquirida en la comunidad, entre pacientes adultos hospitalizados en Nueva Caledonia Objetivo: Describir la etiologia de la neumonia adquirida en la comunidad (NAC) en pacientes adultos hospitalizados en Nueva Caledonia, el archipielago frances del Pacifico Sur. Metodos: Se incluyeron, de forma prospectiva, pacientes con confirmacion de NAC (n = 137.) Los patogenos se detectaron mediante cultivo, metodos moleculares, serologia en sueros pareados, inmunofluorescencia en frotis nasofaringeo y deteccion de antigenos en orina. Resultados: Se determino la etiologia de NAC en 82 de 137 casos (59.8%), de los cuales 31 exhibian dos o mas patogenos (37.8%). Se detectaron 117 patogenos: Streptococcus pneumoniae era el mas comun (41.0%), seguido por el virus de influenza A (22.1%) y Haemophilus influenzae (10.2%). La frecuencia de bacterias atipicas era baja (6.0%). La coinfeccion mas frecuente y significativa era S. pneumoniae con el virus de influenza tipo A (p = 0.004). Se detecto el virus de influenza en frotis nasofaringeo de 4 pacientes (15.4% de los pacientes examinados para influenza) y por PCR de muestras pulmonares en 15 pacientes (57.7%). Conclusiones: S. pneumoniae es la principal causa de NAC en adultos de Nueva Caledonia. Las coinfecciones que involucran a S. pneumoniae y al virus de la influenza son muy comunes durante el invierno. Estos pacientes adultos hospitalizados con NAC son un grupo centinela obvio para la vigilancia epidemiologica de la influenza. Se deberia reforzar la vacunacion frente a influenza y S. pneumoniae cuando se han identificado factores de riesgo. Palabras clave: etiologia; neumonia adquirida en la comunidad; Nueva Caledonia; PCR; virus de la influenza
Databáze: OpenAIRE
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