Étude transcriptomique par mRNA sequencing des lésions cutanées de GVH chronique à type de lichen plan et de morphée chez le patient allogreffé

Autor: A. de Masson, F. Sicre de Fontbrune, Martine Bagot, M. Robin, Jean-David Bouaziz, H. Le Buanec, C. Battail, Armand Bensussan, H. Zouali, J. Lemasson, B. Fin, Gérard Socié, Anne Boland, R. Amode, David Michonneau, Jean-François Deleuze
Rok vydání: 2019
Předmět:
Zdroj: Annales de Dermatologie et de Vénéréologie. 146:A132-A133
ISSN: 0151-9638
DOI: 10.1016/j.annder.2019.09.159
Popis: Introduction La reaction du greffon contre l’hote (GVHD), compliquant l’allogreffe de cellules souches hematopoietiques, est la consequence de l’alloreactivite des cellules immunocompetentes du donneur sur les tissus du receveur. La GVHD chronique (cGVHD) cutanee se presente sous 2 formes differentes sur le plan clinique et pronostique : non sclerotique (lichen plan) et sclerotique (morphee). Elle est traitee par des immunosuppresseurs dont l’indication se pose en fonction de la severite et non du sous-type clinique. Nous avons mene la 1re etude transcriptomique par sequencage de l’ARN messager (mRNA-seq) a haut debit de cGVHD cutanee avec pour objectif de decouvrir de nouvelles signatures transcriptomiques cutanees, communes et propres aux morphees et aux lichens plans de cGVHD, afin de trouver de nouvelles cibles therapeutiques et d’adapter le traitement de ces 2 sous-types differents de cGVHD. Materiel et methodes Trois groupes d’individus ont ete compares : 5 temoins sains, 5 morphees et 7 lichens plans de cGVHD. Les ARN ont ete extraits avec le kit « RNeasy Plus Universal » et le « Tissue Lyser 2 » (Qiagen). Le sequencage oriente de l’ARNm a ete realise sur la plateforme Illumina (sequenceur HiSeq4000) selon la methode paired-end generant des « reads » de 2 × 101 paires de bases avec une profondeur de 50 millions. L’alignement des « reads » sur le genome de reference humain a ete effectue par « STAR » et l’analyse d’expression differentielle de genes par « DESeq2 » utilisant un t test pour comparer et de Benjamini-Hochberg pour determiner le p ajuste. La selection des genes differentiellement exprimes (GDE) repose sur les criteres p ajuste Resultats Les ARN extraits etaient de bonne qualite (RNA Integrity Number > 7,4). Ont ete mis en evidence 1591 et 2058 GDEs respectivement dans la morphee et le lichen plan en comparaison a la peau saine. La comparaison lichen plan versus morphee a revele peu de GDEs (n = 165) (dont l’IL1α) temoignant de transcriptomes plus proches car il s’agit de 2 formes de la meme maladie, mais de transcriptomes incontestablement differents. GSEA a identifie de nombreuses voies enrichies, certaines attendues comme la voie de l’IFN de type I dans les lichens et morphees par rapport aux temoins, ou la voie du TGFβ dans les morphees par rapport aux lichens, d’autres inattendues comme celle du complement dans les lichens. Ces voies sont potentiellement source de nouvelles cibles therapeutiques, par exemple le TGFβ pourrait etre la cible du fresolimumab dans les morphees de cGVHD. Conclusion Cette 1re etude en mRNA-seq de cGVHD cutanee suggere qu’un traitement adapte a la forme de cGVHD est necessaire, ce qui n’est actuellement pas le cas.
Databáze: OpenAIRE
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