Construction and characterization of a metagenomic DNA library from the rhizosphere of wheat (Triticum aestivum)

Autor: M Martínez-Trujillo, Eduardo Valencia-Cantero, R. Hernández-León, Gustavo Santoyo
Rok vydání: 2012
Předmět:
Zdroj: Phyton. 81:133-137
ISSN: 1851-5657
Popis: El suelo rizosferico de las plantas de trigo contiene una alta diversidad de microorganismos y por lo tanto, constituye una gran reserva para el descubrimiento de los genes con diversas aplicaciones de la biotecnologia agricola. En este trabajo, hemos construido una biblioteca metagenomica empleando como huesped heterologo E. coli , clonando grandes fragmentos de ADN genomico en un cromosoma artificial bacteriano (BAC), proveniente de la rizosfera de plantas de trigo. El promedio de los segmentos de ADN clonado vario de 5 a 80 kb, con un tamano promedio de 38 kb. Los extre - mos de varias clonas BAC, tomadas al azar fueron secuenciadas. Los resultados de homologia de los BACs analizados mostraron princi - palmente funciones metabolicas y cataliticas (40%), incluyendo ami - dohidrolasas, hidrolasas, peptidasas, serina proteasas, endonucleasas y exonucleasas. Otra parte interesante de las clonas revelo secuencias genomicas con funcion hipotetica (17%) o desconocida (9%). Las secuencias metagenomicas pertenecen en su mayoria a Firmicutes, Proteobacterias, Arqueas, Actinobacterias, hongos, virus, bacterias y taxones desconocidos sin clasificar. Se espera que la biblioteca meta - genomica del suelo rizosferico de las plantas de trigo siga creciendo. Al mismo tiempo, se estan llevando a cabo analisis funcionales en la busqueda de genes de interes agro-biotecnologico
Databáze: OpenAIRE