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Introduction Depuis 10 ans, la technologie MALDI-TOF a revolutionne l’identification bacterienne en routine dans les laboratoires de bacteriologie. Par ailleurs, en deux ans, la taxonomie des Propionibacterium a ete largement revue avec individualisation du genre Cutibacterium, incluant C. acnes, C. granulosum, C. avidum et 2 nouvelles especes recemment decrites : C. humerusii et C. namnetense. L’objectif de cette etude etait de determiner la prevalence de C. namnetense dans la collection du laboratoire avant l’arrivee du MALDI-TOF et d’investiguer les circonstances de l’isolement clinique. Materiels et methodes Nous avons repris les souches identifiees a Propioniobacterium sp. entre 2010 et 2012. Apres isolement, les souches identifiees initialement par des tests et galeries phenotypiques (Api20A) ont ete identifiees par spectrometrie de masse VitekMS et par identification moleculaire par sequencage des genes gyrB et ARN 16S. Resultats Sur les 269 souches dedoublonnees retrouvees (toutes natures de prelevement confondues), 246 etaient identifiees respectivement a C. acnes, 18 a C. granulosum et 5 a Cutibacterium sp. par les techniques phenotypiques. L’identification spectrale revelait 231 C. acnes, 5 C. granulosum, 14 C. avidum, ainsi que 13 echecs d’acquisition de spectre et 6 souches appartenant a un genre different. En revanche, l’identification moleculaire des 262 Cutibacterium sp. confirmait l’identification de 236 C. acnes, 5 C. granulosum, 17 C. avidum, 1 Propionimicrobium lymphophilum et 3 C. namnetense. Aucun C. humerusii n’etait retrouve. Deux des trois C. namnetense avaient ete identifies a C. acnes et l’un etait en echec d’acquisition de spectre. La prevalence de cette nouvelle espece sur cette periode est de 1,1 %. Deux des trois patients presentaient une osteite comme le patient avec la souche initiale (3/3 et 4/4 prelevements positifs, dans les deux cas). Conclusion C. namnetense, decrit en 2016, s’avere rare dans notre collection. Son tropisme osseux necessite une etude prospective multicentrique, d’autant que nous l’avons retrouve prospectivement dans d’autres prelevements, notamment une spondylodiscite. Son caractere pro-inflammatoire reste a confirmer. Par ailleurs, les modifications taxonomiques et l’emergence de nouvelle espece en clinique imposent une actualisation reguliere des bases de donnees du MALDI-TOF. |
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