������������������ ������ ���������������� �������������������������� ������ ������������ Vitivirus ������ ���������������������� ������ ������������

Jazyk: Greek, Modern (1453-)<br />Greek
Rok vydání: 2020
Předmět:
DOI: 10.26262/heal.auth.ir.320281
Popis: �� �������������� ������������������������ ������ ������������ ������������ ������, ������������ ������ ������������ ������ ���������� �������� ������ ������������ Vitivirus. ���� viti-������ ���������� ������������ ������������������������ ������ �������������� ������ ������������ ���������� ���������������������� ���� ���� ���������������� ������ ������������������ ������ ���������� ������ �������������� (Grapevine rugose wood ��� RW). ���� ������������������ ������������ �� ������������ ���������������� ������ ���������������������� ������������������������ ������������ ���������������� (High - Throughput Sequencing) �������� ������������ �������������� �������� ������������������ ������������ �������� ������ ������ ������������ Vitivirus (�������������������� Betaflexiviridae). ���� 2017, ������ �������������� ������������������������ ������������������ ������ ���������������� ������ ����������, �������������������������������� �������������� HTS ���� ������������ (D2-1) ������ ������������������ ������������, ������ �������� ������������������ ������ ���� �������������������� �������������� (��������-��������������) ������ ������������������, ����������. ������ ������ �������������� ������ �������������������������� ���������������� ������ ���������� �������� ������ �������� ������ ������������ ���������� ������ ���� ������ �� (grapevine virus E, GVE), F (grapevine virus F, GVF) ������ I ������ �������������� (grapevine virus I, GVI), ������ �������������� ������ ���������� Vitivirus. ���� ������������ ������������ ������ ���������������� ������������������ ������������ �� ���������������������� ������ ������������������ ������ ���������� ������ ������ ������������ D2-1, ���� ������ ���������������� ������������ ��������������������. �������� �������������������������������� ���� ������ ���������������� ������ ���������������� ���������������������������� �������������� RT-PCR ������ �������� ���� ������ ���� ������ ���� �������� ���������������� ������ ���������������������� ���������������� ������ ������������������������ �������� ���� ���� ������������ ������������������������ �������� Sanger. ��������, �������������������������� �� ���������������� ������ ���������� ������, ���������������� ������ ����������, ������ ����������������, ������ �������������������� ������ �������������������� ������������������ ������ GVE, GVF ������ GVI ���������� ������������������ ������ ������������������ ����������������������. ������ ������ ������������ �������� �������������� �������������� ������������������ ������������������������ �� ���������������� ������ ���������� ������ ���������� �������������������� ������������������, ������������ ���� �������������������������� ���������������� ������������������ ��������������, ���� ������ GVF ���� ���������������������� ���� �������������������� ������������������ (24,5%) ���� ���������� ���� �������� GVI (2,4%) ������ GVE (1,7%). ����������, ������������������������ ������ �� ���������������� �������������������������������� ������ �������������������� ���� ������������������ ���������������������� ������������ �������� ���������� ������ ���� ���������������������� ������ ������ ������ ���������������� ����������. �� ���������������������� ������ �������������������� �������������� ���������������� ������ ���������������� ������ ���������������������� ������ ������ �������������������� ������������������ ������ ���������� ������, ������ ���������������� ���������������� ������ ������������������ �������������������������� ���������������������� ������ GVI, ������������ ������ ������������ ������������������ ���������������������������������� ������������ ������ ������������������ ������ �������������� ���������������������� ������ ���������� ���������� ��������, ���� ������ GVE ���� ���������� �� ������ ��������������������������������. ���������� �������������������������������� ������������������������ ������ ������������ ������ ������������������ ���������������������� ������ GVE ������ GVF, ������ ���� ������������������ ������ GVI ������������������ ������������ ����������������������. �� ������������������������ �������������� ������ �������������������� ������������ ������ ���������������� ������ �������������������� ������ ������ ���������������������� �������������������� ���������������������������������� ������������ �������������� �������� �������������� ������ ������. ���������������� ���������������� ������ ���� ������������ �������������� ������������ ���� �������������� ���������������� ������ ������ ����������, ������ ������������������ ������ GVI, ���� ������������ ������ �������������� ���������������� �������� ���������������� ��������. �� �������������� ������������������ ���������������������� ������ ������������ �������� ���������� ���������� �������� ������ �������������� ������ �������� ������ ���� ���������������� �������� ���������������� �������������������� ��������.
Grapevine is infected by a high number of viruses, including many members of the genus Vitivirus. Vitiviruses are widespread and some of them are associated with Grapevine Rugose Wood complex (RW). Recently, the widespread application of High-Throughput Sequencing (HTS) technology has led to the detection of many new grapevine viruses, which were classified in the genus Vitivirus. In 2017, HTS was conducted in a grapevine sample of Dafnia variety (D2-1) which was collected from the Grapevine Institute (ELGO-DEMETER) in Lykovrisi, Athens, during a survey of commercial vineyards and grapevine collections. Subsequent analysis of HTS data revealed the presence of a high number of viruses, including Grapevine virus E (GVE), Grapevine virus F (GVF) and Grapevine virus I (GVI), which belong to the genus Vitivirus (family Betaflexiviridae) and whose presence in Greece, until then, remained unknown. The first objective of this study was to confirm the presence of these three viruses in the sample D2-1, with an additional detection method. This was accomplished by the development and application of species-specific RT-PCR and re-amplification and sequencing of segments of their genome by Sanger sequencing. Thus, the presence of these viruses in Greece was confirmed, a fact that fostered the investigation of their incidence in vineyards of the Greek territory. Testing of a large number of samples revealed the presence of these three viruses in Greek vineyards, mainly in grafted indigenous grapevine varieties, with GVF being detected more frequently (24.5%) than GVI (2.4%) and GVE (1.7%). Finally, the intraspecies genetic variability of the three viruses was investigated. Sequencing and comparative analysis of segments of the replicase and the coat protein genes of each virus, and also a segment of the movement protein gene of GVI, revealed the existence of genetic variability between Greek and foreign isolates in all three viruses, with GVE being the most divergent. High variability was also found between the Greek isolates of GVE and GVF, while the populations of GVI showed great homogeneity. Further phylogenetic analysis showed the effect of movement of infected grapevine propagation material and grafting onto rootstocks in the evolution of these viruses. Moreover, it seems that all three viruses and especially GVI can be spread in local level, with vectors that are probably endemic locally in Greece. Further studies on these three new grapevine viruses in our country will lead to their effective management.
Databáze: OpenAIRE