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Introduction L’osteogenese imparfaite (OI) est une maladie osseuse rare a l’origine de fractures et de deformations osseuses. Dans 85 % des cas, elle est due a une mutation autosomique dominante de COL1A1 ou COL1A2. Pour un meme gene mute (COL1A1 ou COL1A2) et pour le meme variant (dans une meme famille par exemple), il existe une grande variabilite de severite phenotypique, sans aucun biomarqueur pour le praticien. En tant que regulateurs epigenetiques de l’expression des genes, les microARNs (miARNs) circulants ont ete decrits dans d’autres maladies osseuses comme etant de potentiels marqueurs pronostiques. L’objectif est d’identifier des miARNs circulant potentiellement associes a la severite de l’OI. Materiels et methodes 10 patients presentant une OI ont ete recrutes en consultation ou hospitalisation dans notre service. Dix controles, apparies sur l’âge et le sexe, ont ete inclus a partir des cohortes OFELY, MODAM, STRAMBO. Le profil des miARNs circulants (miRome) a ete etabli par Next Generation Sequencing (NGS) apres l’extraction de l’ARN total suivi du sequencage des miARNs sur la plateforme Illumina (QIAGEN Genomic Services). Le niveau d’expression des miARNs a ete normalise par TMM (Trimmed Mean of M), exprime en TPM (Transcripts Per Million) et compare entre chaque groupe par le ratio de TPM exprime en donnees relatives (Log2Fold Change). Du fait des comparaisons multiples, nous avons applique la correction du False Discovery Rate (FDR) selon la methode de Benjamini-Hochberg. Resultats L’âge moyen des patients OI est de 41 ans avec un sex-ratio equilibre. Tous les patients presentent une OI de type I. Nous mettons en evidence 79 miARNs differentiellement exprimes entre les deux groupes de maniere significative avec une valeur de p corrigee par FDR inferieure a 0,05 et 27 miARNs avec un p corrige inferieur a 0,0005. Parmi eux, 22 sont sur-exprimes et 5 sont sous-exprimes. Nous avons realise une revue de litterature montrant que 22 parmi ces 27 miARNs sont connus pour etre impliques dans l’homeostasie osseuse. Nous mettons egalement en evidence des clusters de miARNs, c’est-a-dire des miARNs physiquement adjacents sur l’ADN, entierement sur-exprimes, comme les clusters miR-183/96/182 et miR-25/93/106b. L’utilisation de la base de donnees MiRWALK revele que 27/79 miARNs ciblent potentiellement COL1A1 ou COL1A2 avec une probabilite de 100 %. Conclusion Nous avons etabli ici la signature miARN de l’OI de type 1 en mettant en evidence une modification d’expression significative de miARNs potentiellement impliques dans la regulation de genes ayant un role essentiel dans la physiopathologie de l’OI. Ces miARNs seront soumis a une phase de validation par RT-qPCR et de comparaison a la severite clinique sur un plus large effectif de serums afin de valider leur interet en tant que biomarqueur pronostique de la severite de la maladie. |
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