An efficient algorithm for segregation analysis in large populations

Autor: Brian Kinghorn, R. J. Kerr
Rok vydání: 1996
Předmět:
Zdroj: Journal of Animal Breeding and Genetics. 113:457-469
ISSN: 0931-2668
DOI: 10.1111/j.1439-0388.1996.tb00636.x
Popis: Summary A computationally tractable approach to complex segregation analysis for large data sets is described. This is then used to extend the value of DNA tests for major locus genotype, by calculating probabilities of belonging to each genotype class for all animals not DNA tested. Under the conditions simulated, this approach led to an approximate doubling of the number of animals genotyped with 100% confidence, the ability to exclude many more animals from one genotype class, plus a high probability (> 90%) of belonging to a given genotype class for many other animals. Zusammenfassung Verwendung von Spaltungsanalyse fur rationelle Anwendung von DNA Tests fur Hauptgene Ein rechnermasig traktabler Ansatz zu komplexer Spaltungsanalyse groser Datenmengen wird beschrieben. Dieser wird verwendet, um den Wert der DNA Tests fur Hauptgene zu erweitern und zwar dadurch, das die Wahrscheinlichkeiten der Zugehorigkeit zu jeder Genotypenklasse fur Tiere ohne DNA Diagnose berechnet wird. Die Simulation ergab eine Verdopplung der Zahl der Tiere, die mit 100% Sicherheit genotypisiert werden konnten sowie Ausschlus von mehr Tieren aus einer gegebenen Genotypenklasse und schlieslich eine hohe Wahrscheinlichkeit (> 90%) der Zuweisung vieler Tiere zu gegebenen Genotypenklassen.
Databáze: OpenAIRE