Application of a chloroplast DNA marker in seed orchard management evaluations of Douglas-fir
| Autor: | C H Newton, J. E. Webber, Michael Stoehr, T M Vo, J R Gawley, B L Orvar |
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| Rok vydání: | 1998 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Canadian Journal of Forest Research. 28:187-195 |
| ISSN: | 1208-6037 0045-5067 |
| DOI: | 10.1139/x97-201 |
| Popis: | We evaluated pollen contamination, supplemental mass pollination efficacies, and natural selfing in a Douglas-fir (Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco) clonal-row seed orchard using a genetic marker on the paternally inherited chloroplast (cp) genome. A primer pair for the polymerase chain reaction amplification of a variable region on the cpDNA in Douglas-fir was developed. The amplified DNA product was highly variable in size, yielding 13 different haplotype bands from 20 orchard genotypes growing in the clonal-row seed orchard. Observed band sizes ranged from 859 to 1110 base pairs (bp). To estimate variation levels in the orchard background pollen pool, 96 assayed genotypes from surrounding stands gave rise to 36 different haplotypes, ranging from 367 to 1119 bp in size, resulting in a gene diversity estimate of 0.91. Most orchard clonesi haplotypes were also present in the background. After adjusting for the presence of orchard-type haplotypes in the background, contamination was found to be 40%. Natural selfing in six individual clones ranged from 0 to 19% with an average of 6%. Supplemental mass pollination efficacy was estimated to be 55%, ranging from 39 to 73%, depending on the maternal clone and flowering phenology. This DNA marker proved to be very useful in assessing seed orchard mating dynamics and orchard management efficacies for Douglas-fir. Resume : ? liaide diun marqueur gOnOtique dOcoulant du gOnome chloroplastique transmis paternellement chez les conifres, les auteurs ont OvaluO la contamination pollinique, liefficacitO de la pollinisation de masse ainsi que le niveau diautogamie naturelle chez des Douglas taxifoliOs (Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco) rOunis en un verger ‡ graines formO de rangOes clonales. Pour ce faire, les auteurs ont mis au point une paire diamorces diamplification de liADN par PCR. Cette paire diamorces Otait spOcifique ‡ une rOgion variable du gOnome chloroplastique du Douglas taxifoliO. La taille du fragment diADN amplifiO Otait trs variable, permettant la dOtection de 13 fragments diffOrents dihaplotype parmi les 20 gOnotypes utilisOs pour Otablir le verger ‡ graines formO de rangOes clonales. La taille observOe des fragments variait de 859 ‡ 1110 pb. Afin diestimer la diversitO de fragments au sein du bassin de pollen prOsent dans le verger, 96 gOnotypes diffOrents reprOsentatifs des peuplements environnants furent analysOs, ce qui a permis de dOtecter 36 haplotypes diffOrents, qui variaient de 367 ‡ 1119 pb. Liindice de diversitO gOnOtique dOcoulant de cette analyse siOtablissait ‡ 0,91. La plupart des haplotypes dOtectOs parmi les clones du verger furent Ogalement observOs parmi les arbres environnants. La contamination pollinique ‡ liintOrieur du verger fut OvaluOe ‡ 40%, aprs avoir ajustO pour la prOsence des haplotypes du verger parmi les arbres environnants. Le niveau diautogamie naturelle de six clones individuels OtudiOs variait de 0 ‡ 19%, avec une moyenne de 6%. LiefficacitO de la pollinisation de masse fut estimOe ‡ 55%, avec des valeurs variant de 39 ‡ 73%, dOpendemment du clone maternel analysO et de la phOnologie de la floraison. Les auteurs concluent en mentionnant liutilitO manifeste de ce marqueur diADN chez le Douglas taxifoliO pour Ovaluer la dynamique diaccouplement prenant place au sein des vergers ‡ graines et Oprouver les pratiques de gestion des vergers. (Traduit par la ROdaction) |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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