Caracterização Estrutural e Transcricional de Fatores de Transcrição da Família R2R3-MYB no Genoma de Glycine max

Autor: Adriana Polizel-Podanosqui, Luana M. Darben, Francismar Corrêa Marcelino-Guimarães, Valéria S. Lopes-Caitar, Marcia K. Kuwahara, Ricardo Vilela Abdelnoor, Mayra Costa da Cruz Gallo de Carvalho, Luciano Nobuhiro Aoyagi
Rok vydání: 2013
Předmět:
Zdroj: BBR - Biochemistry and Biotechnology Reports. 2:114
ISSN: 2316-5200
DOI: 10.5433/2316-5200.2013v2n3espp114
Popis: As proteinas MYB figuram como uma das maiores familias de fatores de transcricao (FT) presentes em plantas, nas quais desempenham a regulacao de importantes processos, incluindo a defesa. A classe R2R3-MYB e a mais numerosa entre as plantas e a analise da conservacao do seu dominio MYB e seus motivos (C-terminal) permite agrupa-los em subgrupos. Estudos apontam que R2R3 estao envolvidas no controle de processos especificos, incluindo respostas a estresse biotico. Este trabalho objetivou a identificacao e classificacao filogenetica de R2R3-MYBs de soja, atraves de bioinformatica, bem como a analise de expressao dos FTs. A analise de 1390 sequencias proteicas permitiu a identificacao de 264 R2R3-MYBs, classificados em 42 subgrupos, assim como a atribuicao de funcoes putativas dos mesmos. Analise in silico do perfil de expressao dos MYBs (Genevestigator) demonstrou que eles sao induzidos por infeccao por Phakopsora pachyrhizi, tornando-os interessantes alvos para estudos funcionais futuros em soja. Palavras-chave : GmMYB, motivo, filogenia, P. pachyrhizi , soja
Databáze: OpenAIRE