Genetic diversity and population structure of Vibrio choierae in Colombia Diversidad genética y estructura de la población de Vibrio choierae en Colombia

Autor: Agudelo Carlos, Valenzuela de Silva Emilia María, Mantilla Anayá José Ramón, Riaño Pachón Diego Mauricio
Jazyk: Spanish; Castilian
Rok vydání: 2003
Předmět:
Zdroj: Revista Colombiana de Biotecnología, Vol 5, Iss 1, Pp 36-44 (2003)
ISSN: 1909-8758
0123-3475
Popis: Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) was used to study thirty-four Vibrio choierae isolates from the Colombian cholera epidemic between 1991 and 1996. Three Vchoierae isolates not belonging to the epidemic in Colombia and a Vfluvialis isolate were also analysed. The genetic diversity observed for the 38 isolates typified was 0.95, a very similar valué to that obtained by Multilocus Enzyme Electrophoresis (MLEE). No cor reía tion was observed be­tween the variables characterising these isolates (serotype, origin [clinical or environmental], state, electrophoretic type (MLEE) and restriction macro-fragment profile or pulsetype (PFGE)). No evidence of linkage disequilibrium was obtained on evaluating this population with PFGE and MLEE genetic markers. It is suggested that the Vibrio choierae population in Colombia presents a sexual genetic structure. The lack of evidence for linkage disequilibrium and the absence of correlation between the epidemiological, biochemical and molecular variables available sustains such a hypothesis. It is also sustained by the high valué for genetic diversity obtained which could be reflecting the coexistence of several lines of descent having a high genetic flow amongst them. Key words: Vibrio choierae; Pulsed-Field Gel Electrophoresis; molecular epidemiology; population genetics; linkage disequilibrium.Se realizó la electroforesis en gel por campo pulsado (PFGE) de los macrofragmentos de restricción de 34 aislamien­tos de Vibrio choierae pertenecientes a la epidemia de cólera que se presentó en Colombia entre 1991 y 1996, adicionalmente se analizaron 3 aislamientos de V. choierae no pertenecientes a esta epidemia y un aislamiento de V fluvialis. La diversidad genética observada para los 38 aislamientos tipificados fue de 0,95 valor muy similar al obtenido por Electroforesis de Enzimas Multilocus (MLEE). No se observó correlación entre las variables que carac­terizan a estos aislamientos (serotipo, origen [clínico o ambiental], departamento, tipo electroforético (MLEE) y perfil de macrofragmentos de restricción (PFGE)). No se obtuvo evidencia de desequilibrio de ligamiento al evaluar esta población con los marcadores genéticos PFGE y MLEE. Se sugiere que la población de Vibrio choierae en Colom­bia presenta una estructura genética sexual, hipótesis que está soportada por la falta de evidencia de desequilibrio de ligamiento y la ausencia de correlaciones entre las variables epidemiológicas, bioquímicas y moleculares a dispo­sición, y por el alto valor de diversidad genética obtenido, que puede ser el reflejo de la coexistencia de varias líneas de descendencia entre las cuales existe un alto flujo genético. Palabras clave: Vibrio choierae; Electroforesis en gel por campo pulsado; epidemiología molecular; genética de po­blaciones; desequilibrio de ligamiento.
Databáze: OpenAIRE
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