Caractérisation de la communauté microbienne de lisier et de fumiers de porcs par des méthodes moléculaires

Autor: Snell-Castro, Raul
Přispěvatelé: Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Montpellier 2 (Sciences et Techniques)
Jazyk: francouzština
Rok vydání: 2004
Předmět:
Zdroj: Sciences du Vivant [q-bio]. Université Montpellier 2 (Sciences et Techniques), 2004. Français
Caractérisation de la communauté microbienne de lisier et de fumiers de porcs par des méthodes moléculaires, Université Montpellier 2 (Sciences et Techniques)(2004)
Popis: La gestion actuelle des lisiers de porc est identifiée comme une source importante de problèmes environnementaux dus aux grands volumes produits par les exploitations intensives porcines. Des modes de conduite d'élevage alternatifs, comme les élevages sur litière, sont actuellement à l'étude. Le travail présenté ici a consisté dans les caractérisations physico-chimique et microbiologique de lisiers et fumiers de porcs dans le but de mieux comprendre le fonctionnement de ces écosystèmes microbiens. Les résultats obtenus ont montré que le lisier est un écosystème anaérobie mésophile proche de la neutralité contenant de fortes concentrations en ammoniac, en acides gras volatils, et en sulfure d'hydrogène, des composés producteurs de mauvaises odeurs. La structure de sa communauté microbienne est proche de celle trouvée dans les tubes digestifs animaux, notamment chez le porc. L'analyse du système suggère qu'il est probablement dans un état défavorable pour la réalisation efficace de la digestion anaérobie de la matière organique. Le fumier au contraire présente des paramètres physico-chimiques et une structure microbiologique typiques d'un écosystème majoritairement aérobie qui permet l'élimination des composés producteurs d'odeurs cités ci-avant et semble favoriser une disparition plus rapide de la flore fécale porcine. Sur un plan microbiologique, un groupe d'Archaea non cultivées a été observé en abondance dans les lisiers et les fumiers. Ce groupe de fonction inconnue semble originaire et typique de la flore fécale porcine. Un système de PCR en temps réel a été dessiné à partir d'un phylotype bactérien dominant de la flore des déjections pour tester les capacités de cette technique à être appliquée au suivi de micro-organismes sur une filière d'élevage.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: