Recherche de facteurs de transcription impliqués dans la différenciation des fibres G du bois de tension chez le peuplier : analyse de l'expression des gènes de la famille LIM

Autor: Dominique Arnaud, Marie-Claude Lesage Descauses, Nadège Millet, Françoise Laurans, Annabelle Dejardin, Jean-Charles LEPLE, Gilles Pilate
Přispěvatelé: Unité de recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières (AGPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ProdInra, Migration
Jazyk: francouzština
Rok vydání: 2006
Předmět:
Zdroj: 9. Journées du Groupe de Biologie Moléculaire des Ligneux
9. Journées du Groupe de Biologie Moléculaire des Ligneux, Mar 2006, Orléans, France
HAL
Popis: National audience; Le bois de tension chez le peuplier est produit lorsque les tiges se trouvent, suite à une contrainte environnementale, dans une position inclinée par rapport à la verticale. Ce bois, permet le redressement des tiges et se caractérise par la présence de fibres particulières à parois très épaisses appelées fibres G. L'objectif de ce travail consiste en l'identification de facteurs de transcription impliqués dans la différenciation des fibres G du bois de tension. Parmi les 10 000 clones des banques ESTs de bois de peuplier (Populus tremula x alba) de l'INRA d'Orléans (Déjardin et al 2004), la famille LIM (37 EST) est la famille de facteurs de transcription la plus représentée. Six gènes PtaLlM (PtaLlMla, PtaLlMlb, PtaWLlMla, PtaWLlMlb, PtaWLlM2a et PtaPLIM2a) ont été identifiés et les ADNc pleine longueur correspondant à ces gènes ont été obtenus. L'analyse de la répartition de ces EST LIM dans nos banques ainsi que dans les banques populusDB (Populus tremula x tremuloides), nous montre qu'une forte proportion d'EST est issue de jeune xylème de bois tendu. PtaLlMl a est le consensus ayant le plus d'EST provenant en majorité de bois tendu et de xylème mature. Dans le génome du peuplier (Populus trichocarpa), il existe au moins 12 modèles de gène de cette famille: PtLIMla et b, PtWLIM2a et b, PtPLlM2a et b, PtWLIMla et b, PtLIM2a et b, et PtLla et b. La forte homologie de séquence entre ces 6 couples de gènes indique que les gènes PtLIM sont probablement des gènes dupliqués. Des analyses phylogénétiques nous montrent que les protéines PtPLIM2a et b appartiennent au groupe PLIM2 spécifique du pollen chez les plantes et que les protéines PtaWLIM1a et b et PtWLIM2a et b appartiennent respectivement aux groupes WLIM1 et WLIM2 exprimé de manière ubiquitaire (Eliasson et al 2000). Les protéines PtaLIM1a et b, PtL1a et b et PtLIM2a et b formeraient des groupes phylogénétiques distincts. Les résultats d'analyse d'expression par RT-PCR semi-quantitative entre les différents organes de peuplier nous montrent que les gènes PtaLIMont des profils d'expression différents. Tout d'abord, les gènes PtaLIM sont tous plus fortement exprimés dans le jeune xylème du tronc. PtaLIMl a, PtaLIMl b et Pta WLIMI b sont spécifiques des tissus vasculaires (feuilles, racines, tronc). PtaWLlM2a et PtaWLIMla sont exprimés constitutivement dans tous les organes. Et PtaPLlM2a, aussi exprimé dans le xylème, est surtout exprimé dans les étamines. Les analyses RT-PCR menées sur des échantillons de jeune xylème tendu et opposé d'un arbre incliné pendant 15 jours indiquent que l'expression de tous les gènes PtaLlM est induite dans le bois tendu. Enfin, l'induction de l'expression de ces gènes dans le bois tendu varie en fonction du niveau de différenciation du xylème. L'ensemble de ces données sera complété par western blot et immunohistolocalisation. Pour cela, nous avons à notre disposition un anticorps pouvant reconnaître les protéines PtaLIM1a, PtaLIMlb, PtaWLIM1a, et PtaWLIM1b. Et d'autre part nous utiliserons un anticorps dirigé contre la protéine recombinante 6His- PtaLIM 1 a.
Databáze: OpenAIRE
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