Transcriptome Profiling Of Feeding-To-Fasting Transition In Chicken Liver Using A Chicken 20K Oligo Microarray

Autor: Colette Désert, Pierre Blavy, Francois Moreews, Michel DUCLOS, Pascale Leroy, Madeleine Douaire, Christian Diot
Přispěvatelé: Génétique Animale (GARen), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes, Biological systems and models, bioinformatics and sequences (SYMBIOSE), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Systèmes d'Elevage, Nutrition Animale et Humaine (SENAH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes, Système d'Information des GENomes des Animaux d'Elevage (SIGENAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches Avicoles (URA), IFR140-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes-AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Station de recherches avicoles, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2008
Předmět:
Zdroj: International Plant & Animal Genomes XVI Conference
International Plant & Animal Genomes XVI Conference, Jan 2008, San Diego, United States
HAL
Popis: International audience; Starvation triggers a complex array of adaptative metabolic responses including energy-metabolic responses, a process which must imply tissue specific alterations in gene expression profiles. In the chicken, liver is a major organ controlling energy metabolism. The present study aimed to describe the evolution of global gene expression profiles in chicken liver during a 48h fasting period. Liver RNA samples were collected from 4 weeks old broilers, fed ad libitum or fasted for 16h or 48h. Following reverse-transcription and Cy dye labelling, the samples were hybridized on chicken 20K oligochips (ARK-genomics) against a reference sample. The data were then normalized by “Lowess-fitness” and analyzed by analysis of variance using LIMMA package. The number of genes altered by fasting increased from 190 at 16h to 611 at 48h (p
Databáze: OpenAIRE