Amplification of microsatelite markers in peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) andenterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), using koompassia malaccensis benth. andenterolobium cyclocarpum (jacq.) griseb as primers

Autor: Niella, Fernando Omar, Patricia Rocha, Ojeda, Paola, Petruszynski, Guido Andrés, Zapata, Pedro Dario, Otegui, Monica Beatriz
Jazyk: Spanish; Castilian
Rok vydání: 2017
Předmět:
Zdroj: Yvyraretá: Revista Forestal País de Árboles, 12-2017; (25): pp. 60-65 http://yvyrareta.com.ar/index.php
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Universidad Nacional de Misiones
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Popis: Fil: Niella, Fernando Omar. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Forestales; Argentina. Fil: Rocha, Sandra Patricia. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Forestales; Argentina. Fil: Ojeda, Alejandra Paola. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Instituto de Biotecnología Misiones “Dra. María Ebe Reca”. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina. Fil: Petruszynski, Guido Andrés. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Forestales; Argentina. Fil: Zapata, Pedro. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Instituto de Biotecnología Misiones; Argentina. Fil: Zapata, Pedro Darío. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Tecnológicas; Argentina. Fil: Otegui, Mónica Beatriz. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Instituto de Biotecnología Misiones; Argentina. Fil: Otegui, Mónica Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Tecnológicas; Argentina. La fragmentación del hábitat es una realidad global, presente en la Selva paranaense. Entre las especies vulnerables y/o amenazadas por la fragmentación del hábitat, en este ecosistema, podemos mencionar a Peltophorum dubium (Caña fístula) y Enterolobium contortisiliquum (Timbó) que particularmente en Misiones, son de interés para la industria forestal y consideradas especies multipropósitos. No obstante, un uso sostenible de estas especies depende del manejo de la diversidad de especies presentes en estos paisajes y la variación genética dentro de estas. En Argentina no existe información acerca de la calidad genética que se conjugue con las características fenotípicas de dichas especies. En este sentido, los microsatélites son herramientas útiles para estudiar la diversidad genética y la estructura de las poblaciones. El objetivo del presente trabajo fue la amplificación inter-específica de regiones de microsatélites de E. contortisiliquum, utilizando cebadores diseñados para E. cyclocarpum, y de P. dubium, utilizando cebadores diseñados para Koompassia malaccensis. Los resultados obtenidos confirmaron la transferibilidad de los cebadores utilizados para E. contortisiliquum y P. dubium, amplificando regiones microsatélites de las especies estudiadas en poblaciones Argentinas. Este el primer estudio en Argentina que presenta microsatélites candidatos para E. contortisiliquum y P. dubium, que podrían ayudar en la caracterización del germoplasma. The habit fragmentation is a global reality, and very present in the Atlantic Forest. Among the species vulnerable and/or threatened by habitat fragmentation, in the Atlantic Forest, we can mention Peltophorum dubium (Cañafistula) and Enterolobium contortisiliquum (Timbó), which particularly in Misiones, are among the most interest for the forest industry, considered as well as, multipurpose species. However, a sustainable use of these species depends on the management of the diversity of tree species present in landscapes and the genetic variation within them. In Argentina, there is no information about the genetic quality correlated with the phenotypic characteristics of these species. In this sense, microsatellites are very useful tools to study genetic diversity and the structure of populations. The aim of the present work was to achieve the inter-specific amplification of microsatellite regions in E. contortisiliquum, using primers designed for E. cyclocarpum, and in P. dubium, using primers designed for Koompassia malaccensis. The obtained results confirmed the transferability of the primers used for E. contortisiliquum and P. dubium, amplifying microsatellites of the species under study for Argentina ecosystem. This being the first report in Argentina, which presents microsatellite candidates for E. contortisiliquum and P. dubium, which could help in germplasm characterization.
Databáze: OpenAIRE
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