Infections in patients colonized with carbapenem-resistant Gram-negative bacteria in a medium Spanish city

Autor: Soria Segarra, Carmen Gabriela, Serrano García, María Luisa, Navarro Marí, José María, Gutiérrez Fernández, José
Jazyk: Spanish; Castilian
Rok vydání: 2021
Předmět:
Zdroj: Digibug. Repositorio Institucional de la Universidad de Granada
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Popis: Objetivo. Debido a que existen pocos estudios sobre las implicaciones clínicas de la colonización por bacterias gramnegativas resistentes a carbapenémicos (BRC) se analizó ésta en frotis rectales (FR) y faríngeos (FF) y su relación con la capacidad de predecir infección/colonización. Material y métodos. Se realizó un estudio transversal, retrospectivo de los pacientes adultos hospitalizados entre enero del 2016 y diciembre del 2019. Los aislamientos fueron caracterizados mediante MicroScan y espectrometría de masas, aplicando los puntos de corte EUCAST 2018. La detección de carbapenemasas se realizó mediante PCR y secuenciación Sanger; se asignó el secuenciotipo mediante MLST. La relación genética entre los aislados se hizo mediante electroforesis de campo pulsado usando las enzimas Xbal, Spel o Apal. Resultados. Se detectaron 308 (86,03 %) FR y 50 (13,97%) FF positivos, teniendo el FR una sensibilidad del 85%, especificidad del 100%, VPP 100% y VPN 97%. En los FR se aislaron: 44% (n=135) Acinetobacter baumannii, 26% (n=80) Enterobacterales (20 KPC, 29 OXA-48, 22 VIM, 2 IMP, 7 NDM), 17% (n=53) Pseudomonas aeruginosa y 13% (n=40) Stenotrophomonas maltophilia. En los FF se aislaron un 44% (n=22) S. maltophilia, 40% (n=20) A. baumannii, 8% (n=4) P. aeruginosa y 8% (n=4) Enterobacterales (3 VIM, 1 OXA). De los pacientes con tomas simultáneas de FR y FF, 41 (40,6%) tuvieron positividad en ambos frotis, 45 (44,6%) sólo en FR y 15 (14,9%) sólo en FF. En el 81,3% (n=13) de los episodios la colonización precedió a la infección, existiendo asociación entre infección y colonización (p
Objective. Because there are few studies on the clinical implications of colonization by carbapenem-resistant gram-negative bacteria (CRB) this was analyzed in rectal smears (RS) and pharyngeals (PS) and its ability to predict infection/ colonization. Methodology. A cross-sectional, retrospective study from adult inpatients between January 2016 and December 2019 was conducted. The isolates were characterized by MicroScan and spectrometry of masses applying EUCAST 2018 cutoff points. The detection of carbapenemases was performed by PCR and Sanger sequencing; sequencies was assigned by MLST. The genetic relationship between the clinical isolates was made by pulsed field electrophoresis using the enzymes Xbal, Spel or Apal. Results. A total of 308 (86.03%) RS and 50 (13.97%) positive PS were detected, the RS had a 85% sensibility, 100% specificity, 100% positive predictive value and 97% negative predictive value. In RS, the following were isolated: 44% (n =135) Acinetobacter baumannii, 26% (n =80) Enterobacterales (20 KPC, 29 OXA-48, 22 VIM, 2 IMP, 7 NDM), 17% (n=53) Pseudomonas aeruginosa and 13% (n=40) Stenotrophomonas maltophilia. In the PS were isolated 44% (n=22) S. maltophilia, 40% (n = 20) A. baumannii, 8% (n=4) P. aeruginosa and 8% (n=4) Enterobacterales (3 VIM, 1 OXA). From the patients with simultaneous RS and PS, 41 (40.6%) had positivity in both smears, 45 (44.6%) only in RS and 15 (14.9%) only in PS. Colonization preceded infection in 81.3% (n=13) of the isolates; association between infection and colonization was found (p
Databáze: OpenAIRE
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