MOLECULAR CHARACTERIZATION Streptococcus pyogenes FROM INVASIVE INFECTIONS BASED ON VIR-REGULON POLYMORPHISM

Autor: ULLOA F.,M. TERESA, SILVA A.,VIVIANA, PIÑONES A.,ELIZABETH, PORTE T.,LORENA, FICA C.,ALBERTO, PINTO C.,M. EUGENIA
Jazyk: Spanish; Castilian
Rok vydání: 2001
Předmět:
Zdroj: Revista chilena de infectología, Volume: 18, Issue: 3, Pages: 193-202, Published: 2001
Revista chilena de infectología v.18 n.3 2001
SciELO Chile
CONICYT Chile
instacron:CONICYT
Popis: A pesar del aumento de infecciones invasoras por Streptococcus pyogenes: fasceitis necrozante (FN) y síndrome de shock tóxico (SST) en nuestro medio, su caracterización generalmente se limita a identificación de especie y prácticamente no existen estudios moleculares. La literatura describe diversos métodos para tipificar S. pyogenes (MLEE, PFGE y secuen-ciación de emm) que resultan complejos. Una alternativa es la técnica basada en el polimorfismo del regulón vir (emm, emm l, scp A, vir R) que es más sencilla y permite correlacionar los virRLFP con los serotipos M. Objetivo: caracterizar S. pyogenes aislados de cuadros invasores mediante vir-RFLP para establecer relaciones entre cepas locales y extranjeras. Materiales y métodos: se estudiaron 30 cepas de S. pyogenes aisladas de pacientes con cuadros invasores (SST/FN: 8; infecciones de piel y tejidos blandos: 13; infecciones de cavidades estériles: 9) mediante Long PCR-RFLP (amplificación regulón vir con partidores VUF y SBR, seguido de digestión con HaeIII). Resultados: 28/30 (93%) cepas presentaron regulones entre 4,2 - 7,8 Kb y dos entre 1,5 - 1,6 Kb. Se establecieron 14 patrones vir-RFLP y 3 grupos génicos. Dos grupos génicos presentaron patrones similares a los descritos para los serotipos M y se asociaron a una determinada evolución clínica: grupo I, similar a M1 y asociado a infecciones de cavidades estériles; grupo III, similar a M3 y asociado a SST/FN. El grupo II fue heterogéneo en relación a los serotipos, pero concentró las cepas aisladas de infecciones de piel y tejidos blandos. Conclusiones: Las cepas de S. pyogenes aisladas de cuadros severos presentan gran diversidad génica. Sin embargo, tienden a agruparse según serotipo y a asociarse a una determinada evolución clínica destacándose la asociación entre vir-RFLP, tipo serotipo M3 y SST/FN. Las dos cepas con amplicones "pequeños" constituyen un hallazgo interesante, que requiere mayor investigación. Streptococcus pyogenes continues to be an epidemiological problem due to emergence of invasive infections such as necrotizing fasciitis (NF) and toxic shock syndrome (TSS). At present, S. pyogenes characterization is limited to species identification while molecular studies are restricted to a few specialized laboratories. The literature describes several methods of molecular typing (MLEE, PFGE and emm sequence) that are laborious and costly. Alternatively, a technique based on the vir-regulon polimorphism (emm, emm l, scpA, virR) provides a more simple approach and allows the differentiation of the M types based on virRFLP. The purpose of this study was the molecular characterization of S. pyogenes from invasive infections based on vir-regulon polymorphism. A total of 30 S. pyogenes isolates were tested (TSS/NF: 8; skin and tissue infections: 13; sterile site infections: 9) by Long PCR-virRFLP. The PCR product size varied from 4,2 to 7,8 Kb (28/30, 93%). Two strains amplified a small fragment of 1.5 - 1.6 Kb. Fourteen patterns were generated by DNA restriction endonuclease digestion with HaeIII and three genetic groups were established. Two genetic groups were similar to those described for the M protein types and related to the clinical outcome: group I/M1/sterile sites infection and group III/M3/TSS-NF. Group II presented M type heterogeneity and included skin and tissue infections. Genetic diversity in S. pyogenes is common. Nevertheless, isolates from invasive diseases tend to group according to M serotype and clinical outcome.
Databáze: OpenAIRE