Analysis of resistance to Cucumber Mosaic Virus in melon

Autor: Roca Beltran, Judit
Přispěvatelé: Roig Villanova, Irma, Universitat Politècnica de Catalunya. Departament d'Enginyeria Agroalimentària i Biotecnologia, Centre for Research in Agricultural Genomics
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2021
Předmět:
Zdroj: UPCommons. Portal del coneixement obert de la UPC
Universitat Politècnica de Catalunya (UPC)
Popis: Melon is a crop of global economic interest. However, it is threatened by yield losses from all kinds of disease, including Cucumber Mosaic Virus (CMV). After infection, CMV can move cell to cell using a protein called Movement Protein (MP) through its interaction with certain melon proteins. To explore the potential candidate proteins that can interact with MP, a pull-down assay was performed, and some genes encoding candidate proteins as possible interactors were detected. In this study, five genes encoding these candidate proteins were amplified and three of them were successfully cloned into pGADT7 vector using molecular cloning techniques. Once the genes were cloned in the vector, we test their interaction ability with MP using yeast two-hybrid system (Y2H). The results showed that none of the three proteins encoded by these genes interacts with MP. El melón es un cultivo con interés económico mundialmente. No obstante, es susceptible a algunos tipos de enfermedades como el Virus del Mosaico del Pepino (CMV), las cuales causan pérdidas en el rendimiento del cultivo. Cuando la planta ha sido infectada por el virus, el CMV es capaz de moverse de célula en célula ayudándose de una proteína llamada Movement Protein (MP) mediante la interacción de esta con ciertas proteínas del melón. Para explorar las proteínas que pueden interactuar con la MP se realizó un ensayo de inmunoprecipitación de proteínas y se detectaron algunos genes codificantes de proteínas candidatas como posibles interactores. En este estudio, cinco genes que codifican estas proteínas candidatas fueron amplificados, de los cuales tres de ellos fueron clonados con éxito en el vector pGADT7 usando técnicas de clonaje molecular. Una vez clonados los genes en el vector, su capacidad de interacción con la MP fue testada mediante el sistema del doble híbrido de levadura. El resultado mostraba que ninguna de las tres proteínas codificadas por estos genes interactúa con la MP. El meló és un cultiu amb interès econòmic mundialment. No obstant, el meló és susceptible a alguns tipus de malalties com el Virus del Mosaic del Cogombre (CMV), les quals causen pèrdues en el rendiment del cultiu. Quan la planta ha estat infectada pel virus, el CMV és capaç de moure’s de cèl·lula en cèl·lula amb l’ajut d’una proteïna anomenada Movement Protein (MP) mitjançant la interacció d’aquesta amb certes proteïnes del meló. Per explorar les proteïnes potencials candidates que poden interaccionar amb la MP, es va realitzar un assaig de immunoprecipitació (IP) de proteïnes i es van detectar alguns gens codificants de proteïnes candidates com a possibles interactors. En aquest estudi, cinc gens que codifiquen algunes de les proteïnes candidates van ser amplificats, dels quals tres d’ells van ser clonats amb èxit en el vector pGADT7 usant tècniques de clonació molecular. Un cop clonats els gens al vector, la seva capacitat d’interacció amb la MP va ser testada mitjançant la tècnica del doble híbrid en llevat. El resultat mostrava que cap de les tres proteïnes codificades per aquests gens interactua amb la MP. Objectius de Desenvolupament Sostenible::15 - Vida d'Ecosistemes Terrestres
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: