Quantitative trait loci in pepper genome control the effective population size of two RNA viruses at inoculation

Autor: Tamisier, L., Rousseau, Elsa, Barraille, S., Nemouchi, G., Szadkowski, M., Mailleret, Ludovic, Grognard, Frédéric, Fabre, F., Moury, B., Palloix, A.
Přispěvatelé: Unité de Pathologie Végétale (PV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biological control of artificial ecosystems (BIOCORE), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Santé et agroécologie du vignoble (UMR SAVE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB)-Institut des Sciences de la Vigne et du Vin (ISVV)-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), Szent István University. Gödöllo, HUN., Station de Pathologie Végétale (AVI-PATHO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité Mixte de Recherche en Santé Végétale (INRA/ENITA) (UMR SAVE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB)-Institut des Sciences de la Vigne et du Vin (ISVV), Unité de recherche Génétique et amélioration des fruits et légumes (GALF), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2016
Předmět:
Zdroj: 16. Eucarpia Capsicum and Eggplant meeting
16. Eucarpia Capsicum and Eggplant meeting, Szent István University. Gödöllo, HUN., Sep 2016, Kecskemét, Hungary. 591 p
XVI-Eucarpia Capsicum and Eggplant Meeting
XVI-Eucarpia Capsicum and Eggplant Meeting, Sep 2016, Kecskemét, Hungary. pp.169--176
Popis: International audience; Infection of plants by viruses is a complex process that involves several steps: inoculation into plant cells, replication in inoculated cells, cell-to-cell movement during leaf colonization and long-distance movement during systemic infection. The success of the different steps is conditioned by the effective viral population size (Ne) defined as the number of individuals that pass their genes to the next generation. During the infection cycle, the virus population will endure several bottlenecks leading to drastic reductions in Ne and to the random loss of sorne virus variants. If strong enough, these bottlenecks could act against selection by eliminating the fittest variants. Therefore, a better understanding of how plant affects Ne rnay contribute to the developrnent of durable virus-resistant cultivars. We aimed to (i) identify plant genetic factors that control Ne at the inoculation step, (ii) understand the mechanisms used by the plant to control Ne and (iii) compare these genetic factors with other genes controlling virus life cycle and plant resistance durability. The virus effective population size was measured in a segregating population of 152 doubled-haploid lines of Capsicum annuum. Plants were inoculated mechanically either with a Patata virus Y (PVY) construct expressing the green fluorescent protein (OFP), or a necrotic variant of Cucumber mosaic virus (CMV), the CMV-N strain of Fulton. Ne was assessed by counting the number ofprimary infection foci observed on inoculated cotyledons under UV light for PVY -OFP or the number of necrotic local lesionsobserved on inoculated leaves for CMY-N. The numbers of primary infection foci and locallesions were correlated arnong the doubled-haploid lines (r=0.57) and showed a high heritability (h2=0.93 and 0.98 for PVY and CMV, respectively). The effective population size of the two viruses was shown to be controlled by botb common quantitative trait loci (QTLs) and virus-specifie QTLs, indicating the contribution ofboth general and specifie mechanisms. The PVY-specific QTL colocalizes with a QTL that had previously been shown to be involved in PVY accumulation and capacity to break amajor-effect resistance gene down.
Databáze: OpenAIRE
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