Lanternfish Diaphus spp. specimens of a DNA barcoding survey of the mesopelagic micronekton communities of the New Caledonia and Wallis-and-Futuna EEZ

Autor: Borsa, Philippe, Lagrange, Damien, Millet, Laurent, Vourey, Elodie
Přispěvatelé: Institut de recherche pour le développement (IRD), UMR 250 entropi, Aix Marseille Université (AMU), Institut de recherche pour le développement (IRD), Secretariat of the Pacific Community (Secretariat of the Pacific Community), Secretariat of the Pacific Community, UE, IRD, SPC, contributions personnelles des auteurs, Aix-Marseille Université, European Project
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2022
Předmět:
Zdroj: [Research Report] Institut de recherche pour le développement (IRD); Aix-Marseille Université; Secretariat of the Pacific Community. 2022
Popis: This document includes 25 plates of annotated photographs of lanternfish Diaphus spp. specimens collected during cruises ESSCHA, NECTAlis, PUFFAlis and WALLAlis of R.V. Alis in the Coral Sea, the Fiji Basin, and the Pacific Ocean around Wallis-and-Futuna Islands. Specimens were grouped by operational taxonomic unit, defined (OTU) as the cluster to which they belonged in a phylogenetic tree of sequences of a portion of the CO1 gene. Species assignment was initially based on the morphological identification of reference specimens, i.e., particularly-well preserved specimens that exhibit the diagnostic characters mentioned in diagnoses and iden-tification keys from the published literature. In several instances, the same species was represented by distinct OTUs.; Ce document comprend 25 planches de photographies annotées de spécimens de poissons-lanternes du genre Diaphus récoltés lors des campagnes ESSCHA, NECTAlis, PUFFAlis et WALLAlis du R.V. Alis dans la mer de Corail, le bassin des Fidji et l'océan Pacifique autour des îles Wallis-et-Futuna. Les spécimens ont été regroupés par unité taxonomique opérationnelle (OTU), définie comme le groupe auquel ils appartenaient dans un arbre phylogénétique des séquences d'un fragment du gène de la CO1. L'attribution à l’espèce a initialement été faite à partir de l'identification morphologique de spécimens de référence, c'est-à-dire de spécimens particulièrement bien conservés qui présentent les caractères diagnostiques mentionnés dans la littérature. Dans plusieurs cas, la même espèce était représentée par des OTUs distinctes.
Databáze: OpenAIRE