Mapeo fino de la presencia de suturas en la corteza del fruto del melón en una población de RILS

Autor: Elvira Leon, Ana Ma
Přispěvatelé: Centre for Research in Agricultural Genomics, Simó Cruanyes, Joan, Pujol Abajo, Marta
Jazyk: Spanish; Castilian
Rok vydání: 2017
Předmět:
Zdroj: Recercat. Dipósit de la Recerca de Catalunya
instname
UPCommons. Portal del coneixement obert de la UPC
Universitat Politècnica de Catalunya (UPC)
Popis: The melon plant, Cucumis melo L., is an ideal model in the field of genetic improvement for the study of the relevant characters of agricultural interest. The objective of this work was the realization a fine mapping of Quantitative Trait Loci (QTL) that determines the character of the presence of sutures in the rind of melon. This QTL was identified in previous studies with a population of Recombinant Inbread Lines (RILs) from a parental without sutures, of an elite Spanish variety as "Piel de Sapo" (PS) from the botanical group inodorus; and another parental with presence of sutures of the elite French variety Védrantais (Ved) from the cantalupensis botanical group. In this present work we have used an F2 population from PS x Ved. The 920 individuals of F2 has been evaluated and 44 recombinant individuals have been identified in the interval in which the gene has been detected. The DNA extractions from each of the plants, the genotyping by PCR using TaqMan and KASPar technologies, and the qualitative phenotyping of the recombinants plants, have served to reduce the interval of QTL related to the presence of sutures until 834 kb. In this region there are 47 genes, among those the responsible for the character of sutures. La planta del meló, Cucumis melo L., és un model idoni en l'àmbit de millora genètica per a l'estudi dels caràcters rellevants d'interès agrícola. L'objectiu d'aquest treball ha estat la realització d'un mapeig fi del Quantitative Trait Loci (QTL) que determina el caràcter de la presència de sutures en l'escorça del fruit en meló. Aquest QTL va ser identificat en anteriors estudis amb una població de línies pures recombinants, o comunament conegudes com RILs (Recombinant Inbread Lines), a partir d'un parental sense sutures, el cultivar elit espanyol "Pell de Gripau" (PS) del grup botànic inodorus; i un altre parental amb presència de sutures procedent del cultivar elit francès "Védrantais" (Ved) del grup botànic cantalupensis. En el present treball hem utilitzat una població F2 del creuament PS x Ved. S'ha avaluat 920 individus de la població F2 dels quals, s'han identificat 44 individus recombinants en l'interval en què s'ha detectat el gen. Les extraccions de ADN de cadascuna de les plantes, el genotipat mitjançant PCR utilitzant tecnologies TaqMan i Kaspar, i el fenotipat qualitatiu dels individus recombinants, ha servit per reduir l'interval del QTL que determina la presència de sutures, a 834 kb. En aquesta regió es troben 47 gens, entre els quals el responsable del caràcter de sutures. La planta del melón, Cucumis melo L., es un modelo idóneo en el ámbito de mejora genética para el estudio de los caracteres relevantes de interés agrícola. El objetivo de este trabajo ha sido la realización de un mapeo fino del Quantitative Trait Loci (QTL) que determina el carácter de la presencia de suturas en la corteza del fruto en melón. Este QTL fue identificado en anteriores estudios con una población de líneas puras recombinantes, o comúnmente denominadas RILs (Recombinant Inbread Lines), a partir de un parental carente de suturas, el cultivar élite español "Piel de Sapo" (PS) del grupo botánico inodorus; y otro parental con presencia de suturas procedente del cultivar élite francés "Védrantais" (Ved) del grupo botánico cantalupensis. En el presente trabajo hemos utilizado una población F2 del cruce PS x Ved. Se ha evaluado 920 individuos de la población F2, de los cuales se han identificado 44 individuos recombinantes en el intervalo en el que se ha detectado el gen. Las extracciones de ADN de cada una de las plantas, el genotipado mediante PCR utilizando tecnologías TaqMan y KASPar, y el fenotipado cualitativo de los individuos recombinantes, ha servido para reducir el intervalo del QTL que determina la presencia de suturas, a 834 kb. En esta región se encuentran 47 genes, entre los cuales el responsable del carácter de suturas.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: