Intégration de données 'Omic' et compréhension des mécanismes sous-jacents à la production de foie gras

Autor: François, Yoannah, Liaubet, Laurence, Molette, Caroline, Vignal, Alain, MARTY-GASSET, Nathalie, Marie-Etancelin, Christel
Přispěvatelé: Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], ProdInra, Archive Ouverte
Jazyk: francouzština
Rok vydání: 2017
Předmět:
Zdroj: 12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras
12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI-Institut Technique de l'Aviculture, 1124 p., 2017
12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI-Institut Technique de l'Aviculture, 1124 p., 2017, 12èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras
www.itavi.asso.fr/jra/2017
Popis: A QTL program in mule ducks for fatty liver led to the identification of 80 phenotypic QTLs and 176 pQTL ofprotein abundances in fatty liver. In order to give meaning to these numerous results, we first tested thehypothesis of pleiotropic QTLs between a protein and a phenotype when the 2 traits presented QTLs colocalizedon the genome, using the CLIPtest software: among the 66 co-locations observed, we concluded of 16possible pleiotropic QTLs and, for 21 cases, of 2 distinct but linked QTLs. Building graphs of inference usingthe Gephi software made possible to visualize the results. Thus the melting rate of liver is regulated by apleiotropic QTL which simultaneously impacts two distinct alpha-enolase’s spots, which demonstrate that alocus on chromosome 15 participatesin the regulation of the glycolytic pathway. On chromosome 7, a QTLaffecting both the thigh weight and the apolipoprotein A1 was identified, confirming the central role of thisprotein in the transport and storage of lipids. The pleiotropic QTL of the Z chromosome associates the GLUD1protein and the blood glucose level after force-feeding, the GLUD1 gene modulating the hepatic absorption ofthe glucose by the liver via insulin production. None of these 16 pleiotropic QTLs were cis-QTL, confirming thecomplexity of metabolic regulation of the phenotype.
Un programme de détection de QTL d’intérêts du canard mulard a conduit à l’identification de 80 QTLphénotypiques et de 176 pQTL d’abondances protéiques quantifiées dans le foie gras. Afin de donner sens àcette masse de résultats, nous avons en premier lieu testé l’existence de QTL pléiotropiques entre une abondanceprotéique et un phénotype lorsque ces 2 QTL étaient co-localisés sur le génome, à l’aide du logiciel CLIPtest :parmi les 66 co-localisations observées, nous avons conclu à la possible existence d’un QTL pléiotropique pour16 cas et pour 21 cas à 2 QTLs distincts mais liés. La réalisation de graphiques d’inférence à l’aide du logicielGephi a permis de visualiser les résultats. Ainsi le taux de fonte du foie gras est régulé par un QTL pléiotropiquequi impacte simultanément 2 spots distincts de l’alpha-énolase, ce qui met en évidence sur le chromosome 15 unlocus impliqué dans la régulation de la voie glycolytique. Sur le chromosome 7, un QTL affectant conjointementle poids de la cuisse et l’apolipoprotéine A1 a été mis en évidence, confirmant le rôle central de cette protéinedans le transport et le stockage des lipides. Le QTL pléiotropique du chromosome Z associe la protéine GLUD1et le taux de glucose sanguin après un repas de gavage, le gène GLUD1 modulant l’absorption hépatique duglucose par le foie via la production d’insuline. Aucun de ces 16 QTLs pléiotropiques ne met en oeuvre un cis-QTL, confirmant la complexité des régulations métaboliques jouant sur un phénotype.
Databáze: OpenAIRE
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