Genetic diversity of Rhizoctonia solaniAG-3PT, the etiological cause of stem canker and black scurf in Colombian potatoes
| Autor: | Edisson Chavarro-Mesa, Néstor Andrés Herrera-Blanco, Camilo Rubén Beltrán-Acosta, Alba Marina Cotes-Prado, Jorge Evelio Ángel-Díaz |
|---|---|
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2021 |
| Předmět: |
Ribosomal DNA
ADN ribosomal random amplified microsatellites(rams) Agriculture (General) fungi food and beverages Agriculture Random amplified microsatellites (RAMs) SF1-1100 amplificación aleatoria de microsatélites (RAMs) S1-972 Animal culture Solanum phureja Thanatephorus cucumeris Solanum tuberosum |
| Zdroj: | Cienc. Tecnol. Agropecuaria, 22(3): e1888 Ciencia y Tecnología Agropecuaria, Vol 22, Iss 3 (2021) Repositorio Institucional UTB Universidad Tecnológica de Bolívar instacron:Universidad Tecnológica de Bolívar Ciencia y Tecnología Agropecuaria, Volume: 22, Issue: 3, Article number: e1888, Published: 31 AUG 2021 |
| Popis: | Stem canker and black scurf are potato diseases caused by the fungus Rhizoctonia solani, anastomosis group 3 (AG-3PT). This fungus affects potato roots, stems, and tubers, reducing crop yields. This study aims to determine the genetic diversity of R. solani AG-3PT obtained from the Colombian departments of Antioquia, Boyacá, and Cundinamarca. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the ITS-5.8S ribosomal DNA region allowed the differentiation and specific identification of AG-3PT and AG2-1 anastomosis groups. These results confirm that AG-3PT is the primary causative agent and etiological origin of stem canker and black scurf in Colombia. Two distinct subgroups within R. solani AG-3PT were identified using random amplified microsatellite markers (RAMs); AG-3PT (A) shares a similarity index of 78 %, and AG-3PT (B) shares a similarity of 79 % among its isolates. These subgroups were not linked to a geographical origin but to the AG group to which they belong. Nei’s genetic diversity [D] of 0.25 confirmed the high genetic diversity for AG-3PT through RAMs analysis, related to a high evolutive potential within the AG-3PT group in Colombia. Finally, the R. solani AG-3PT fungus obtained from Cundinamarca had the adaptative potential to emerge as a pathogen of Solanum phureja in Colombia, possibly due to the similarity between pathosystems. Resumen El chancro del tallo y la sarna negra de la papa son enfermedades ocasionadas por el hongo Rhizoctonia solani grupo de anastomosis tres (GA-3PT), el cual afecta raíces, tallos y tubérculos de papa y reduce el rendimiento de los cultivos. El objetivo de la presente investigación fue determinar la diversidad genética de R. solani GA-3PT presente en los departamentos colombianos de Antioquia, Boyacá y Cundinamarca. La restricción enzimática de la región ribosomal (RFLP, por sus siglas en inglés) ITS-5.8S permitió la diferenciación e identificación específica de los grupos de anastomosis GA-3PT y GA2-1 y confirmó que el GA-3PT es el principal agente causal y origen etiológico de la enfermedad en Colombia. Mediante amplificación aleatoria de marcadores microsatélites (RAMs), por sus siglas en inglés), se observaron dos agrupamientos dentro de R. solani GA-3PT; el GA-3PT (A) comparte un índice de similitud del 78 % entre sí, en comparación con el GA-3PT (B) que presenta una similitud del 79 % entre sus aislamientos. Los agrupamientos no están relacionados con su origen geográfico, sino con el grupo de anastomosis al que pertenecen. La diversidad genética de Nei [D] de 0,25 confirma una alta diversidad genética para el GA-3PT mediante análisis RAMs, relacionada con un alto potencial evolutivo al interior del grupo GA3PT en Colombia. Finalmente, el hongo R. solani GA-3PT que se obtuvo en Cundinamarca tiene potencial adaptativo para emerger como patógeno de la papa criolla (Solanum phureja) en Colombia, posiblemente, debido a la semejanza de los patosistemas. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|