Avaliação da associação entre doença alérgica e periodontite : uma abordagem bioinformática

Autor: Patrício, Fernanda Maria Peixoto
Přispěvatelé: Figueiredo, Maria Alexandra, Mascarenhas, Paulo, Maurício, Paulo
Jazyk: portugalština
Rok vydání: 2021
Předmět:
Zdroj: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
instacron:RCAAP
Popis: Dissertação para obtenção do grau de Mestre no Instituto Universitário Egas Moniz Introdução: As doenças alérgicas são distúrbios multifatoriais influenciadas por fatores genéticos, infeciosos e ambientais e que podem ter uma inter-relação com a periodontite. A randomização mendeliana e a rede de interação proteína-proteína permitem uma análise simples e de baixo custo sobre a interação entre duas ou mais doenças, com a utilização de dados já disponíveis nos bancos de dados bioinformáticos de Estudos de Associação do Genoma Humano. Metodologia: Foi utilizado a plataforma MrBase para efetuar a randomização mendeliana dos dados obtidos a partir do banco de dados do Instituto Europeu de Bioinformática de Estudos da Associação do Genoma Humano. Para análise da rede de interação proteína-proteína, foi utilizada a ferramenta STRING, onde foram geradas as redes de interação a partir dos dados dos genes envolvidos na periodontite e doença alérgica identificados na base de dados. Resultados: Os resultados da randomização mendeliana não mostraram relação unidirecional significativa entre asma e periodontite (MR Egger B= 0.066 SE= 0.043 p= 0.129 nem entre doença alérgica (asma, febre do feno e eczema) e periodontite (MR Egger B= -0.295 SE= 0.216 p= 0.179). As propriedades da rede foram analisadas, indicando que a rede de interação proteína-proteína teve mais interações entre si do que o que seria esperado para um conjunto aleatório de proteínas de tamanho semelhante sugerindo que essas duas condições podem possuir vias comuns que podem ser exploradas em futuros estudos. De acordo com a rede obtida, SMURF2, cuja atividade está associada ao desenvolvimento da periodontite, interage com RUNX3, SMURF1 e SMAD3, que têm um papel na doença alérgica. Por outro lado, a proteína HLA-DOA, com níveis correlacionados com a periodontite, um modulador chave na via de apresentação restrita do antígeno HLA classe II, foi ligada a vários peptídeos derivados de antígenos que acessam a rota endocítica na doença alérgica (HLA-DRB1, HLA-B e HLA-DRA). Conclusão: Não foram encontradas relações significativas entre a doença alérgica (asma, febre do feno e eczema) e asma com a periodontite na randomização mendeliana, que possam apoiar uma associação de causa-efeito entre essas condições alérgicas e o desenvolvimento de periodontite. Mais trabalhos precisam ser realizados para investigar o papel dessas proteínas que interagem avaliando o potencial de pertencerem a uma via comum que uma vez perturbada pode levar ao desenvolvimento de ambas as condições. Introduction: Allergic diseases are multifactorial disorders influenced by genetic, infectious and environmental factors that may have an interrelationship with periodontal disease. Mendelian randomization and the protein-protein interaction network allow for a simple and low-cost analysis of the interaction between two or more diseases, using data already available in the Human Genome Association Studies Bioinformatics databases. Methodology: The MrBase app was used to analyze the Mendelian randomization using data available from the Human Genome Association Studies Bioinformatics databases database, to analyze the protein-protein interaction network, the STRING tool was used, where the networks of interaction from the data of genes involved in periodontal disease and allergic disease identified in the database. Results: The results of Mendelian randomization did not show a significant unidirectional relationship between asthma and periodontal disease (MR Egger B= 0.066 SE= 0.043 p= 0.129) nor between allergic disease (asthma, hay fever and eczema) and periodontal disease (MR Egger B = -0.295 SE= 0.216 p= 0.179). The properties of the network were analyzed, indicating that the protein-protein interaction network had more interactions with each other than would be expected for a random set of proteins of similar size suggesting that these two conditions may have common pathways that can be explored in future studies. According to the obtained network, SMURF2 which is part of the periodotal disease pathway, interacts with RUNX3, SMURF1 and SMAD3 present in allergic disease. The HLA-DOA protein, present in periodontal disease, a key modulator in the restricted HLA class II antigen presentation pathway, has been linked to several peptides derived from antigens that access the endocytic pathway in allergic disease (HLA-DRB1, HLA-B e HLA-DRA). Conclusion: No significant relationships were found between an allergic disease with periodontitis in Mendelian randomization, which could support a cause-effect association between these allergic conditions and the development of periodontitis. More work needs to be done to investigate the role of these interacting proteins, evaluating the potential of belonging to a common pathway that, once disturbed, can lead to the delayed development of both conditions.
Databáze: OpenAIRE
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