Clostridioides difficile chez des équidés autopsiés, Constitution et caractérisation de la collection de souches CloDifEqui
Autor: | Petry, Sandrine, Tapprest, Jackie, Maillard, Karine, Duquesne, Fabien, Le Neindre, Killian, Barbut, Frédéric, Poquet, Isabelle, Bridoux, Ludovic |
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Přispěvatelé: | Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), LABÉO, Pôle d’analyses et de recherche de Normandie (LABÉO), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), IFCEAnsesINRAE |
Jazyk: | francouzština |
Rok vydání: | 2021 |
Předmět: |
Clostridiodes difficile ‐ Equidés ‐ collection de souches ‐ génotypage ‐ phénotypage
[SDV.BA.MVSA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry Molecular Biology/Molecular biology [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology |
Zdroj: | SFM 16eme Congres National Microbes 2021 SFM 16eme Congres National Microbes 2021, Sep 2021, Nantes, France. Livre des résumés |
Popis: | National audience; Clostridioides difficile est un entéro‐pathogène majeur, anaérobie et sporulant. Il provoque, par sestoxines, des diarrhées post‐antibiotiques difficiles à traiter et des récidives fréquentes dans lesquellesles biofilms pourraient jouer un rôle. Le portage asymptomatique de souches toxinogènes quin’expriment pas les gènes de toxines participe à leur persistence et leur virulence pourra s’exprimerchez un autre hôte. C. difficile pose un problème de santé humaine, à l’hôpital et dans la communauté,mais aussi vétérinaire. Chez les animaux qui peuvent disséminer des spores et contaminer l’homme,l’importance de C. difficile reste mal évaluée : sa recherche n’est pas systématique, et celle de sestoxines encore plus rare..Le projet CloDifEqui de l’Anses et l’INRAe, qui est financé notamment par l’Institut Français du Chevalet de l’Equitation, consiste à évaluer la fréquence de C. difficile chez les équidés autopsiés de 2019 à2021 à l’Anses quelle que soit la cause de la mort.A chaque autopsie, les données de l’animal (individuelles, cliniques, épidémiologiques) sontenregistrées et du contenu intestinal est prélèvé pour rechercher C. difficile. Les souches isoléesd’espèce confirmée constituent la collection CloDifEqui. Leurs principaux caractères génotypiques(gènes des toxines, ribotype …) et phénotypiques (sporulation, mobilité, résistance aux antibiotiques,formation de biofilm …) sont en cours d’étude et seront comparés à ceux de souches d’origine humaineou animale. En parallèle, un diagnostic d’infection est établi en collaboration avec le CNR C. difficile parla recherche des toxines dans les contenus intestinaux présentant C. difficile et provenant d’équidésavec des signes d’infection intestinale. Cela permettra d’établir la fréquence de C. difficile chez leséquidés, à la fois en cas d’infection et de portage asymptomatique. Les résultats de caractérisation dessouches seront croisés avec les données individuelles et cliniques des animaux autopsiés, notammentleurs traitements antibiotiques antérieurs éventuels.Après 80 autopsies, la collection CloDifEqui comprend 20 souches isolées d’animaux différents etcaractériéses. L’analyse croisée de l’ensemble des données et résultats est en cours. Le projet devraitcontribuer à mieux comprendre l’épidémiologie de C. difficile chez les équidés et à évaluer lacirculation des souches, leur potentiel de transmission zoonotique et de persistance. |
Databáze: | OpenAIRE |
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