Data from a proteomic analysis highlight different osmoadaptations in two strain of Propionibacterium freudenreichii
| Autor: | Gaucher, Floriane, Bonnassie-Rouxin, Sylvie, Rabah, Houem, Leverrier, Pauline, Pottier, Sandrine, Jardin, Julien, Briard-Bion, Valérie, Marchand, Pierre, Jeantet, Romain, Blanc, Philippe, Jan, Gwenael |
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| Přispěvatelé: | Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Bioprox, Université de Rennes (UR), Berlin-Brandenburgische Akademie der Wissenschaften (BBAW), Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Institut des Sciences Chimiques de Rennes (ISCR), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plate-forme Rennaise d'Imagerie et Spectroscopie Structurale et Métabolique (PRISM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Catholique de Louvain (UCL), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes-Université de Rennes 1 (UR1) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2020 |
| Předmět: |
propionibacterium freudenreichii
protéomique souche bactérienne stress osmoadaptation analyse comparative Osmoadaptation [SDV]Life Sciences [q-bio] Microbiology and Parasitology Propionibacterium adaptation au stress Proteomic Probiotic Stress Microbiologie et Parasitologie Osmotic [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology Cheese Alimentation et Nutrition [SDV.IDA.SMA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering/domain_sdv.ida.sma Food and Nutrition Osmoprotectant base de données protéomique [SDV.IDA.GPA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering/domain_sdv.ida.gpa protéome [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition comparaison génomique |
| Zdroj: | Data in Brief Data in Brief, 2020, 28, pp.104932. ⟨10.1016/j.dib.2019.104932⟩ Data in Brief, Elsevier, 2020, 28, pp.104932. ⟨10.1016/j.dib.2019.104932⟩ Data in Brief (28), 104932. (2020) |
| ISSN: | 2352-3409 |
| DOI: | 10.1016/j.dib.2019.104932⟩ |
| Popis: | The article presents a proteomic data set generated by a comparative analysis of the proteomes of Propionibacterium freudenreichii, comparing the CIRM-BIA 129 and CIRM-BIA 1025 strains. The two strains were cultivated until the beginning of the stationary phase in a chemical defined medium (MMO), and in this medium in the presence of NaCl, with or without glycine betaine. Whole-cell proteins were extracted, trypsinolyzed and analyzed by nano LC-MS/MS, prior to identification and classification by function using the X!Tandem pipeline software and the proteomic data from NCBI.nlm.nigh.gov. Quantification of proteins was then carried out in order to detect change in their expression depending on the culture medium. This article is related to the research article entitled “Benefits and drawbacks of osmotic adjustment in Propionibacterium freudenreichii”. The comparative proteomic analysis of the two strains reveal strain-dependent and medium-dependent stress proteomes in the probiotic P. freudenreichii. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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