Using realtime polymerase chain reaction for taxonomic and quantitative analysis of multicomponent probiotics that are used in pediatrics
| Autor: | Kitam, V.O., Yankovsky, D.S., Shirobokov, V.P., Dyment, G.S., Litovchenko, O.V., Shevchenko, L.M., Shevchenko, T.V. |
|---|---|
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2020 |
| Předmět: |
полімеразна ланцюгова реакція реального часу
праймери ДНК мультикомпонентні пробіотики бактерії real-time polymerase chain reaction DNA multicomponent probiotic preparations microorganism праймеры бактерии днк полимеразная цепная реакция реального времени Pediatrics праймеры ДНК мультикомпонентные пробиотики RJ1-570 |
| Zdroj: | Сучасна педіатрія: Україна, Iss 2(106), Pp 69-82 (2020) Modern Pediatrics. Ukraine; № 2(106) (2020): Modern pediatrics. Ukraine; 69-82 Современная педиатрия. Украина; № 2(106) (2020): Современная педиатрия. Украина; 69-82 Сучасна педіатрія. Україна; № 2(106) (2020): Сучасна педіатрія. Україна; 69-82 |
| ISSN: | 2706-6134 2663-7553 |
| Popis: | The methods for determining the qualitative and quantitative composition of multicomponent probiotics play an important role in their development and investigation. Both taxonomic identification and quantitative analysis of such multisymbiosis components can be significantly accelerated with application of modern methods based on the detection and identification of DNA sequences by polymerase chain reaction (PCR). One of the main requirements for this method is the purity of the isolated DNA and the absence of polymerase chain reaction inhibitors in its content. In the course of study, we developed a method for using polymerase chain reaction in real time for qualitative and quantitative determination of the species composition in multicomponent probiotic preparations containing representatives of 18 species of genera Bifidobacterium, Lactobacillus, Propionibacterium, Lactococcus, Streptococcus and Acetobacter. This method allows rapid and accurate research of samples in the presence of various inhibitors of polymerase chain reaction. Важную роль в разработке и исследовании многокомпонентных пробиотиков играют методы определения их качественного и количественного состава. Как таксономическая идентификация, так и количественный анализ компонентов такого мультисимбиоза могут быть значительно ускорены с применением современных методов, основанных на выявлении и идентификации последовательностей ДНК с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР). Одним из основных требований к данному методу является чистота выделенной ДНК и отсутствие ингибиторов ПЦР в ее содержимом. В ходе работы был разработан метод использования ПЦР в реальном времени для качественного и количественного определения видового состава бактерий в многокомпонентных препаратах пробиотиков, которые содержат представителей 18 видов родов Bifidobacterium, Lactobacillus, Propionibacterium, Lactococcus, Streptococcus и Acetobacter. Этот метод позволяет быстро и точно исследовать образцы в присутствии разных ингибиторов ПЦР. Важливу роль у розробці та дослідженні багатокомпонентних пробіотиків відіграють методи визначення їх якісного та кількісного складу. Як таксономічна ідентифікація, так і кількісний аналіз компонентів таких мультисимбіозів можуть бути значно прискорені із застосуванням сучасних методів, заснованих на виявленні та ідентифікації послідовностей ДНК за допомогою полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР). Однією з основних вимог до даного методу є чистота виділеної ДНК та відсутність інгібіторів ПЛР у її вмісті. У ході роботи розроблено метод використання ПЛР в реальному часі для якісного та кількісного визначення видового складу в багатокомпонентних пробіотичних препаратах, що містять представників 18 видів родів Bifidobacterium, Lactobacillus, Propionibacterium, Lactococcus, Streptococcus та Acetobacter. Цей метод дозволяє швидко і точно досліджувати зразки в присутності різних інгібіторів ПЛР. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|