Sélection artificielle de communautés microbiennes : effet de la diversité génétique et rôle des interactions interspécifiques

Autor: Raynaud, Tiffany, Devers, Marion, Ayme, Spor, BLOUIN, Manuel
Přispěvatelé: EL Mjiyad, Noureddine, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Jazyk: francouzština
Rok vydání: 2021
Předmět:
Zdroj: Journée des doctorants UMR Agroécologie
Journée des doctorants UMR Agroécologie, Apr 2021, Virtuel, France
Popis: National audience; La sélection artificielle, à l'origine des espèces animales et végétales utilisées en agriculture, alongtemps été appliquée à l’échelle de l’individu. Il est possible de transposer cette procéduresur des holobiontes, communautés ou écosystèmes ; toutefois, cela ajoute un niveau decomplexité puisque le phénotype cible de la sélection résulte de la présence de plusieurs espèceset, potentiellement, de leurs interactions. L'ambition de ce projet est i) de déterminer si unediversité génétique microbienne élevée permet d'améliorer l'efficacité de la sélection artificiellede communautés microbiennes et ii) de déterminer si les interactions entre espèces sontimpliquées dans la mise en place du phénotype d’une communauté et si elles évoluent au coursde la sélection artificielle. Une première démarche de sélection artificielle de communautésbactériennes reconstruites en laboratoire a permis de mettre en évidence que l’effet d’unesélection pour une productivité élevée tend à être influencé par la richesse initiale de lacommunauté sélectionnée, de façon non linéaire. Dans une deuxième approche, la productivitéde communautés bactériennes composées d’espèces ayant une histoire évolutive commune ounon a été mesurée. L’analyse de ces résultats permettra de déterminer si les interactionsinterspécifiques peuvent être des unités de sélection et ainsi contribuer à l’évolution d’unecommunauté. Enfin, nous discuterons du rôle des interactions dans la mise en place duphénotype d’une communauté en analysant la prédictibilité du profil métabolique d'unecommunauté sur la base des capacités métaboliques des individus qui la composent. L'ensembledes résultats permettra de contribuer à la compréhension des dynamiques écologiques etévolutives à des niveaux d'organisation supérieurs à celui de l'individu
Databáze: OpenAIRE
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